More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1062 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  100 
 
 		 157 aa  320  6e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  76.43 
 
 		 157 aa  246  8e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  69.23 
 
 		 156 aa  233  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  69.23 
 
 		 156 aa  233  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  69.23 
 
 		 156 aa  233  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  69.23 
 
 		 156 aa  233  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  68.59 
 
 		 158 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  68.59 
 
 		 156 aa  231  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  68.59 
 
 		 156 aa  231  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  68.59 
 
 		 156 aa  231  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  68.59 
 
 		 156 aa  231  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1277  peptide deformylase  69.23 
 
 		 156 aa  216  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3966  peptide deformylase  68.59 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  51.92 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  51.66 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  53.55 
 
 		 170 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  52.41 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  50.68 
 
 		 154 aa  148  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  48.3 
 
 		 152 aa  144  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  48.97 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  49.66 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  50 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  49.66 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  50.75 
 
 		 172 aa  140  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  50 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  47.92 
 
 		 170 aa  135  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  47.92 
 
 		 170 aa  135  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  51.41 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1757  peptide deformylase  48.72 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  47.95 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1501  peptide deformylase  48.67 
 
 		 174 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  48.05 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  50 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  49.29 
 
 		 185 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  48.65 
 
 		 173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  49.31 
 
 		 171 aa  130  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  46.15 
 
 		 168 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  46.15 
 
 		 168 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  46.15 
 
 		 168 aa  130  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  45.75 
 
 		 172 aa  130  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  48.34 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1783  peptide deformylase  45.33 
 
 		 172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  44.76 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  45.1 
 
 		 170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  46.31 
 
 		 178 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  46.21 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  45.1 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  45.45 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  45.39 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  48.97 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  42.48 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  43.14 
 
 		 169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  45.21 
 
 		 178 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  44.76 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0018  peptide deformylase  48 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  47.55 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  44.76 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  46.31 
 
 		 180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2031  peptide deformylase  42.68 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00573318  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  44.76 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  44.76 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0600  peptide deformylase  45.1 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  43.75 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  44.06 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0438  polypeptide deformylase  45.1 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  45.52 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  48.25 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  47.86 
 
 		 185 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1690  peptide deformylase  44 
 
 		 172 aa  124  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.736434  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0184  peptide deformylase  49.32 
 
 		 175 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.55747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  45.1 
 
 		 169 aa  124  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0201  peptide deformylase  49.32 
 
 		 175 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2387  peptide deformylase  47.95 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  45.83 
 
 		 169 aa  124  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  47.14 
 
 		 185 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1508  peptide deformylase  45.22 
 
 		 177 aa  124  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  47.65 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2160  peptide deformylase  43.33 
 
 		 171 aa  123  8.000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  44.67 
 
 		 167 aa  123  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  44.67 
 
 		 167 aa  123  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0222  peptide deformylase  48.65 
 
 		 175 aa  122  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  44.79 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  43.51 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  48.65 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  47.62 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  43.79 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  48 
 
 		 185 aa  121  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  43.14 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  43.75 
 
 		 169 aa  121  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1477  peptide deformylase  45.39 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0031  peptide deformylase  42.66 
 
 		 199 aa  121  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  47.14 
 
 		 185 aa  120  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0407  peptide deformylase  43.51 
 
 		 166 aa  120  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447377  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  41.56 
 
 		 168 aa  120  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  43.51 
 
 		 170 aa  120  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  43.51 
 
 		 170 aa  120  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  46.26 
 
 		 168 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  46.26 
 
 		 168 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0024  peptide deformylase  42.66 
 
 		 188 aa  120  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0038  peptide deformylase  41.18 
 
 		 169 aa  120  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.346284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>