More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1232 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  100 
 
 		 152 aa  300  5.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  57.72 
 
 		 152 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  55.41 
 
 		 164 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  55.78 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  55.17 
 
 		 155 aa  167  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  57.14 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1757  peptide deformylase  58.62 
 
 		 166 aa  159  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  49.01 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  52.38 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  50.34 
 
 		 166 aa  153  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  52.59 
 
 		 170 aa  148  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  49.38 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  51.72 
 
 		 169 aa  146  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  52.41 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  51.72 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  48.3 
 
 		 157 aa  144  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  48.97 
 
 		 185 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  48.28 
 
 		 185 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  48.28 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  50.34 
 
 		 169 aa  141  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  52.7 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  47.62 
 
 		 157 aa  140  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  47.59 
 
 		 185 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  48.28 
 
 		 178 aa  140  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  46.3 
 
 		 169 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  53.08 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  46.3 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  46.3 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  46.3 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  46.91 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  46.3 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  46.3 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  46.91 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  46.3 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  46.91 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  46.3 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  46.91 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  46.91 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  46.3 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  45.68 
 
 		 170 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  46.3 
 
 		 169 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  45.06 
 
 		 170 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  47.59 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  46.3 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  47.62 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  46.9 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  44.83 
 
 		 168 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  47.59 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  45.68 
 
 		 170 aa  134  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  44.74 
 
 		 173 aa  134  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  45.52 
 
 		 167 aa  133  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  47.59 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  47.59 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  46.58 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  47.59 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  44.72 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  48.99 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  44.83 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  43.45 
 
 		 177 aa  131  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  44.83 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  44.14 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  44.14 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  44.14 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  43.45 
 
 		 167 aa  130  5e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  44.83 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  43.45 
 
 		 167 aa  130  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  44.83 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  44.83 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  44.14 
 
 		 170 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  44.14 
 
 		 170 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  44.14 
 
 		 170 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  42.33 
 
 		 178 aa  130  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  44.14 
 
 		 170 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  44.83 
 
 		 170 aa  130  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  44.14 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  44.14 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  44.14 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  44.14 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  46.94 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  43.45 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  44.14 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  44.83 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2142  peptide deformylase  46.58 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.644494 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2219  peptide deformylase  46.58 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.025374  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  45.27 
 
 		 171 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  44.83 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  45.27 
 
 		 170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  44.14 
 
 		 170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  44.14 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  45.95 
 
 		 171 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2319  peptide deformylase  45.89 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000135964  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  44.59 
 
 		 170 aa  127  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  45.27 
 
 		 170 aa  127  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  45.52 
 
 		 170 aa  126  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  45.52 
 
 		 170 aa  126  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0407  peptide deformylase  45.89 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447377  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2530  peptide deformylase  45.21 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0035  peptide deformylase  44.14 
 
 		 170 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0880297 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  45.14 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  43.45 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>