More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09890 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  100 
 
 		 180 aa  370  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1713  peptide deformylase  63.48 
 
 		 183 aa  243  9e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07980  peptide deformylase  65.52 
 
 		 175 aa  228  4e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0868  peptide deformylase  43.86 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.226218  normal  0.184037 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  39.29 
 
 		 174 aa  141  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  39.76 
 
 		 171 aa  141  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  39.76 
 
 		 171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  42.14 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  40.94 
 
 		 171 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  44.59 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  39.77 
 
 		 171 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  37.65 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  40.35 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  40.46 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  40.35 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  38.73 
 
 		 187 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  38.73 
 
 		 187 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  44.3 
 
 		 157 aa  131  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  43.02 
 
 		 169 aa  130  9e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  42.11 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  42.11 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  46 
 
 		 150 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  41.14 
 
 		 185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  40.12 
 
 		 192 aa  127  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  46.1 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  46.1 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  43.26 
 
 		 187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  37.87 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  40.83 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  43.54 
 
 		 178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  37.87 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  43.97 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  46.31 
 
 		 157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  44.59 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  40.35 
 
 		 185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  41.1 
 
 		 201 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  40.72 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  41.38 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  42.07 
 
 		 170 aa  124  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  43.97 
 
 		 174 aa  124  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  40.25 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  40.35 
 
 		 169 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  40.41 
 
 		 201 aa  124  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  39.53 
 
 		 170 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  39.53 
 
 		 170 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  40.7 
 
 		 196 aa  124  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  37.06 
 
 		 201 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  46.53 
 
 		 170 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  41.51 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2579  peptide deformylase  37.65 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.231026  hitchhiker  0.00000660539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  41.89 
 
 		 173 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  39.04 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  37.8 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  41.96 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  41.96 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  42.76 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  43.75 
 
 		 172 aa  121  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  37.58 
 
 		 182 aa  121  6e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  44.67 
 
 		 173 aa  120  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  42.47 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  45.71 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  37.72 
 
 		 178 aa  120  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  43.75 
 
 		 169 aa  120  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  43.75 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  45 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  47.79 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  48.15 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0043  peptide deformylase  35.71 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.715813  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  39.49 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  35.71 
 
 		 177 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  40.48 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  39.49 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  42.95 
 
 		 156 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  41.89 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  45 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  38.82 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  40.54 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  40.54 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  41.22 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  36.36 
 
 		 201 aa  118  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  39.61 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  37.89 
 
 		 164 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  41.73 
 
 		 147 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  40.79 
 
 		 179 aa  118  6e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  42.95 
 
 		 156 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  44.2 
 
 		 170 aa  117  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  44.2 
 
 		 170 aa  117  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  42.95 
 
 		 156 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  39.88 
 
 		 173 aa  117  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  38.82 
 
 		 213 aa  117  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  43.92 
 
 		 154 aa  117  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  41.96 
 
 		 179 aa  117  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  40.54 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  40.54 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  39.19 
 
 		 171 aa  117  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  42.58 
 
 		 167 aa  117  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  45.39 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  43.06 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  35.47 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  38.95 
 
 		 178 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>