More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1333 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  100 
 
 
156 aa  313  4e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  58.17 
 
 
154 aa  170  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  55.19 
 
 
164 aa  164  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  54.9 
 
 
154 aa  161  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  54.9 
 
 
152 aa  157  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  54.55 
 
 
166 aa  156  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  57.24 
 
 
155 aa  154  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  48.7 
 
 
159 aa  154  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  51.3 
 
 
170 aa  152  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  49.35 
 
 
154 aa  150  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  52.98 
 
 
150 aa  150  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  51.01 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  50 
 
 
158 aa  143  8.000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  50 
 
 
173 aa  142  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  48.97 
 
 
147 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  52.7 
 
 
152 aa  141  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  48.72 
 
 
171 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  48.97 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  50.31 
 
 
167 aa  137  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  47.44 
 
 
176 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  48.05 
 
 
167 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  47.44 
 
 
171 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  50 
 
 
172 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  45.57 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  46.45 
 
 
156 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  46.45 
 
 
156 aa  133  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  46.45 
 
 
156 aa  133  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  48.63 
 
 
167 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  45.81 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  45.81 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  45.81 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  45.81 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  46.1 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  47.95 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  46.9 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  48.7 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  47.95 
 
 
167 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  47.26 
 
 
181 aa  131  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  47.95 
 
 
167 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  45.89 
 
 
157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  45.21 
 
 
171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  46.58 
 
 
171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  50.68 
 
 
170 aa  130  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  50.68 
 
 
170 aa  130  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  48.97 
 
 
179 aa  130  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  48.05 
 
 
182 aa  130  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  47.26 
 
 
167 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  47.26 
 
 
167 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  45.89 
 
 
171 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  49.32 
 
 
169 aa  130  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  47.26 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  45.39 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  47.95 
 
 
168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  44.24 
 
 
193 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  44.52 
 
 
158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  47.59 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1757  peptide deformylase  52.6 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  47.95 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  47.59 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  46.15 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  47.59 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  47.59 
 
 
216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  48.63 
 
 
177 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  48.05 
 
 
169 aa  128  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  47.59 
 
 
167 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  47.59 
 
 
179 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  47.59 
 
 
179 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  46.75 
 
 
185 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  45.89 
 
 
167 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  46.9 
 
 
181 aa  128  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  48.23 
 
 
164 aa  128  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  43.59 
 
 
174 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  46.58 
 
 
169 aa  128  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  43.59 
 
 
175 aa  128  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  45.89 
 
 
169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  45.45 
 
 
168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  43.92 
 
 
183 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  46.9 
 
 
181 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  44.52 
 
 
171 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  45.21 
 
 
167 aa  127  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  46.1 
 
 
185 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  43.83 
 
 
182 aa  127  7.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1604  polypeptide deformylase  44.37 
 
 
155 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000418701  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  46.75 
 
 
168 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  49.65 
 
 
192 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  44.16 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  46.1 
 
 
185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  44.16 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  46.1 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  44.52 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  46.58 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  41.18 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  47.02 
 
 
185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1885  polypeptide deformylase  44.37 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.366875  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  44.16 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  40.38 
 
 
187 aa  124  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  40.38 
 
 
187 aa  124  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  49.36 
 
 
170 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  42.86 
 
 
172 aa  124  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  44.81 
 
 
172 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>