More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_03091 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  100 
 
 		 201 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  71.14 
 
 		 201 aa  311  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  75.25 
 
 		 201 aa  310  1e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  70.71 
 
 		 201 aa  294  6e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  68.53 
 
 		 202 aa  292  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  68.02 
 
 		 202 aa  290  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  62 
 
 		 203 aa  265  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  61.93 
 
 		 201 aa  263  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  61.93 
 
 		 201 aa  261  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  61.93 
 
 		 201 aa  261  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  58.24 
 
 		 187 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  56.04 
 
 		 187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  56.04 
 
 		 187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  55.19 
 
 		 192 aa  215  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  54.4 
 
 		 187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  52.17 
 
 		 187 aa  206  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  52.75 
 
 		 187 aa  202  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  53.55 
 
 		 188 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  47.55 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  48.95 
 
 		 174 aa  143  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  47.55 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  47.55 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  47.1 
 
 		 172 aa  141  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  46.85 
 
 		 171 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  48.25 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  50.36 
 
 		 188 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  45.89 
 
 		 176 aa  138  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  44.97 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  49.28 
 
 		 168 aa  136  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  44.9 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  44.31 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  42.31 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  44.97 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  44.97 
 
 		 168 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  42.58 
 
 		 193 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  47.22 
 
 		 177 aa  134  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  44.22 
 
 		 174 aa  134  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  48.55 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  49.28 
 
 		 170 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  41.04 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  47.48 
 
 		 168 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  41.04 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  45.64 
 
 		 171 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  42.6 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  44 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  48.2 
 
 		 178 aa  131  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  47.33 
 
 		 185 aa  131  7.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  48.2 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  42.68 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  44 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  41.03 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  43.23 
 
 		 179 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  44.59 
 
 		 168 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  44.2 
 
 		 168 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  43.14 
 
 		 169 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  44.59 
 
 		 168 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  41.94 
 
 		 167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  41.94 
 
 		 167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  40.51 
 
 		 170 aa  128  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  40.51 
 
 		 170 aa  128  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  43.48 
 
 		 168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  43.48 
 
 		 168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  40.37 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  47.1 
 
 		 170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  47.1 
 
 		 170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  42.04 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  41.94 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  43.84 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  43.79 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  45.19 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  45.45 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  44.68 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  44.68 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  41.94 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  42.95 
 
 		 171 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4570  peptide deformylase  45 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  41.94 
 
 		 179 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  41.94 
 
 		 167 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  41.94 
 
 		 179 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  38.51 
 
 		 169 aa  126  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  42.28 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  41.29 
 
 		 167 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  41.29 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  41.94 
 
 		 181 aa  124  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  37.13 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  47.83 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  40.13 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  37.06 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  44.97 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  42.75 
 
 		 168 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  46.03 
 
 		 152 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  43.05 
 
 		 173 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  42.01 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  44.2 
 
 		 167 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  41.18 
 
 		 168 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  47.1 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  44.2 
 
 		 169 aa  123  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  42.95 
 
 		 175 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  40.94 
 
 		 171 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  41.29 
 
 		 179 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>