More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0372 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  100 
 
 		 169 aa  338  2e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  59.75 
 
 		 162 aa  199  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  48.15 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0191  peptide deformylase  47.47 
 
 		 162 aa  158  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0691522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  48.03 
 
 		 164 aa  154  8e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  48.03 
 
 		 164 aa  151  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  42.86 
 
 		 174 aa  144  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  43.1 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  41.61 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  41.61 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  41.61 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  42.01 
 
 		 178 aa  131  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1026  peptide deformylase  46.75 
 
 		 168 aa  131  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000768351  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  49.26 
 
 		 152 aa  131  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  38.41 
 
 		 183 aa  130  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  39.05 
 
 		 171 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  41.61 
 
 		 168 aa  130  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  44.44 
 
 		 177 aa  130  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  39.26 
 
 		 177 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  42.17 
 
 		 170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  39.26 
 
 		 177 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  41.61 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  40.99 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  36.59 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  37.74 
 
 		 201 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  39.19 
 
 		 201 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  39.19 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  40.11 
 
 		 188 aa  127  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  40.99 
 
 		 168 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  42.86 
 
 		 192 aa  127  8.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  41.62 
 
 		 170 aa  127  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  39.13 
 
 		 170 aa  127  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  42.24 
 
 		 169 aa  127  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  49.29 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  35.93 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  42.2 
 
 		 170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  44.64 
 
 		 178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  38.51 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  43.51 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  44.59 
 
 		 189 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  40.37 
 
 		 168 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  40.37 
 
 		 168 aa  124  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  41.94 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  42.04 
 
 		 196 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  37.36 
 
 		 193 aa  124  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  39.86 
 
 		 203 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  41.92 
 
 		 189 aa  122  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  40.54 
 
 		 202 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  38.98 
 
 		 180 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  38.46 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  42.57 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  40.54 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  40.83 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  44.16 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  39.86 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  42.57 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  38.1 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  37.8 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0017  peptide deformylase  38.18 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.746118  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  36.49 
 
 		 201 aa  121  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  38.65 
 
 		 185 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  40.85 
 
 		 177 aa  120  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  39.51 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  36.69 
 
 		 171 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  39.41 
 
 		 177 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  38.65 
 
 		 185 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  38.27 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  36.49 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  36.49 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  36.47 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  40.62 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  39.74 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  41.1 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  38.85 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  37.89 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  39.1 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  42.28 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  38.89 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  40.49 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  41.61 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  38.51 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  36.96 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  38.51 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  38.56 
 
 		 186 aa  118  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  38.51 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  38.65 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  42.67 
 
 		 188 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  38.51 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  37.89 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  39.62 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  40.99 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  40.12 
 
 		 178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  38.75 
 
 		 173 aa  117  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  39.62 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  37.58 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  35.81 
 
 		 201 aa  117  7e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  38.04 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  40.79 
 
 		 181 aa  117  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>