More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2896 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  100 
 
 		 188 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  68.09 
 
 		 177 aa  253  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  67.02 
 
 		 180 aa  243  8e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  58.51 
 
 		 175 aa  216  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  56.91 
 
 		 187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  55.85 
 
 		 175 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  57.07 
 
 		 175 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  54.89 
 
 		 187 aa  210  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  54.89 
 
 		 187 aa  210  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  53.23 
 
 		 175 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  53.23 
 
 		 175 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  53.76 
 
 		 175 aa  205  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  52.69 
 
 		 175 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  53.76 
 
 		 172 aa  201  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  51.87 
 
 		 171 aa  200  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  52.41 
 
 		 171 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  57.14 
 
 		 173 aa  197  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  54.3 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  51.34 
 
 		 174 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  53.48 
 
 		 174 aa  194  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  50.54 
 
 		 171 aa  192  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  50.54 
 
 		 171 aa  192  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  50 
 
 		 171 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  51.61 
 
 		 171 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  51.37 
 
 		 168 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  51.12 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  50 
 
 		 173 aa  182  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  49.2 
 
 		 177 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  50.27 
 
 		 168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  50.82 
 
 		 168 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  50.82 
 
 		 168 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  52.46 
 
 		 168 aa  181  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  51.91 
 
 		 168 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  48.11 
 
 		 177 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  48.11 
 
 		 177 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  49.46 
 
 		 193 aa  178  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  51.37 
 
 		 168 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  50.82 
 
 		 168 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  51.37 
 
 		 168 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  50 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  50.54 
 
 		 168 aa  174  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4570  peptide deformylase  50 
 
 		 173 aa  173  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  48.59 
 
 		 174 aa  173  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  50 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  50 
 
 		 168 aa  171  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  47.31 
 
 		 182 aa  171  7.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  47.85 
 
 		 187 aa  171  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  48.92 
 
 		 178 aa  169  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  51.37 
 
 		 177 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  49.46 
 
 		 178 aa  169  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  49.47 
 
 		 172 aa  168  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4240  peptide deformylase  48.92 
 
 		 173 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  45.9 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4749  peptide deformylase  48.39 
 
 		 173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  46.24 
 
 		 184 aa  164  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  44.92 
 
 		 176 aa  164  9e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  45.7 
 
 		 184 aa  164  9e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  48.13 
 
 		 181 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  47.59 
 
 		 170 aa  161  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  47.59 
 
 		 167 aa  161  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  48.66 
 
 		 179 aa  161  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  49.74 
 
 		 188 aa  161  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  47.59 
 
 		 167 aa  160  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  48.13 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  48.13 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  47.59 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  48.13 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  48.13 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  43.01 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  48.13 
 
 		 167 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  48.13 
 
 		 179 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  48.13 
 
 		 179 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  47.54 
 
 		 169 aa  158  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  50 
 
 		 178 aa  158  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  47.06 
 
 		 167 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  48.17 
 
 		 170 aa  157  7e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  47.06 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  47.64 
 
 		 170 aa  157  7e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  47.06 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1032  peptide deformylase  43.48 
 
 		 163 aa  157  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209609  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  46.77 
 
 		 170 aa  157  8e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  46.77 
 
 		 170 aa  157  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  45.21 
 
 		 171 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  46.99 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  46.52 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  47.54 
 
 		 169 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  45.21 
 
 		 171 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  47.62 
 
 		 170 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  46.24 
 
 		 167 aa  154  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  43.55 
 
 		 171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  44.92 
 
 		 168 aa  151  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  45.45 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  45.36 
 
 		 168 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  44.97 
 
 		 170 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  45.25 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  45.9 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4639  peptide deformylase  45.3 
 
 		 173 aa  148  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  43.72 
 
 		 171 aa  148  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3350  peptide deformylase  46.81 
 
 		 172 aa  147  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954138  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  44.39 
 
 		 167 aa  147  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>