More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_00761 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  100 
 
 		 201 aa  413  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  71.14 
 
 		 201 aa  311  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  66 
 
 		 201 aa  291  6e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  68.18 
 
 		 202 aa  286  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  65 
 
 		 201 aa  286  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  68.18 
 
 		 202 aa  285  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  64.5 
 
 		 201 aa  284  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  65 
 
 		 201 aa  284  8e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  64.5 
 
 		 201 aa  283  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  63 
 
 		 203 aa  261  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  59.78 
 
 		 187 aa  228  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  59.78 
 
 		 187 aa  228  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  57.3 
 
 		 187 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  56.67 
 
 		 192 aa  223  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  55.43 
 
 		 187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  54.7 
 
 		 187 aa  210  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  52.46 
 
 		 188 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  53.59 
 
 		 187 aa  205  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  44.31 
 
 		 168 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  48.2 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  44.31 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  48.2 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  48.92 
 
 		 174 aa  144  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  47.65 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  51.01 
 
 		 172 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  49.64 
 
 		 188 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  48.2 
 
 		 175 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  46.31 
 
 		 168 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  44.97 
 
 		 168 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  43.71 
 
 		 168 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  46.76 
 
 		 176 aa  141  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  42.86 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  46.76 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  44.3 
 
 		 168 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  44.29 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  44.3 
 
 		 168 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  45.32 
 
 		 171 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  45.64 
 
 		 168 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  42.31 
 
 		 193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  48.92 
 
 		 178 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  45.95 
 
 		 168 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  46 
 
 		 167 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  49.32 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  43.62 
 
 		 168 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  46.04 
 
 		 171 aa  134  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  41.89 
 
 		 173 aa  134  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  42.57 
 
 		 174 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  49.25 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  46.38 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  46.38 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  46.62 
 
 		 184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  42.04 
 
 		 189 aa  132  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  47.4 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  47.76 
 
 		 179 aa  131  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  45.64 
 
 		 167 aa  131  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  42.66 
 
 		 171 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  45.27 
 
 		 170 aa  131  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  42.66 
 
 		 171 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  42.14 
 
 		 174 aa  131  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  44 
 
 		 169 aa  130  9e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  45.1 
 
 		 177 aa  130  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  45.33 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  46.21 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  43.54 
 
 		 170 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  43.54 
 
 		 170 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  45.32 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  43.64 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  41.1 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  44 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  44.93 
 
 		 167 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4570  peptide deformylase  44.6 
 
 		 173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  44.93 
 
 		 167 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  44.29 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  45.27 
 
 		 184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  39.24 
 
 		 188 aa  128  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07980  peptide deformylase  46.27 
 
 		 175 aa  128  6e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  43.42 
 
 		 179 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  43.42 
 
 		 179 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  45.83 
 
 		 177 aa  128  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  44.67 
 
 		 173 aa  127  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  46.27 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  41.5 
 
 		 180 aa  127  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  44.14 
 
 		 177 aa  127  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  44.93 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  44.2 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  41.67 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  43.33 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  40.38 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  45.19 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  41.5 
 
 		 177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  39.86 
 
 		 171 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  45.1 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  43.07 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  45.07 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  45.65 
 
 		 167 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  43.48 
 
 		 167 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  43.24 
 
 		 163 aa  125  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  42.67 
 
 		 175 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  41.18 
 
 		 177 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  43.05 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>