More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0898 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  100 
 
 		 185 aa  376  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  71.19 
 
 		 186 aa  271  3e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  67.78 
 
 		 188 aa  251  5.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  65.17 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  64.8 
 
 		 199 aa  243  8e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  64.97 
 
 		 190 aa  242  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  61.24 
 
 		 185 aa  228  4e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  42.62 
 
 		 186 aa  151  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  44.62 
 
 		 189 aa  148  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  43.62 
 
 		 190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  41.8 
 
 		 196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1904  peptide deformylase  41.67 
 
 		 192 aa  144  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  40.33 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  49.69 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  37.95 
 
 		 194 aa  137  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  48.45 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  43.17 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  46.3 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  46.58 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  48.08 
 
 		 176 aa  135  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  42.26 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  43.79 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  43.2 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  39.58 
 
 		 196 aa  131  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  40.88 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  40.1 
 
 		 196 aa  131  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  45.57 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  40 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  45.7 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  42.07 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  46.71 
 
 		 192 aa  128  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  40.36 
 
 		 172 aa  127  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  43.87 
 
 		 173 aa  127  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  44.17 
 
 		 202 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  44.17 
 
 		 202 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  43.2 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  43.93 
 
 		 178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  39.76 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  47.02 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  39.16 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  44.77 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  44.37 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  45.18 
 
 		 184 aa  125  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  39.77 
 
 		 182 aa  124  6e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  43.98 
 
 		 170 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1326  hypothetical protein  37.57 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.368395 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  41.57 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  42.01 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  43.98 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  43.48 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  40.85 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  42.58 
 
 		 150 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  40.85 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  39.77 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  45.28 
 
 		 169 aa  122  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  39.63 
 
 		 164 aa  122  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  40.36 
 
 		 167 aa  121  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  42 
 
 		 164 aa  121  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  45.64 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  46.15 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  45.64 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  41.92 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  41.46 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  41.5 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  39.02 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  40.48 
 
 		 167 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  40.36 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  37.13 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  41.98 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  45.95 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  40.24 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  43.62 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  38.24 
 
 		 177 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  38.24 
 
 		 177 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  40.59 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2031  peptide deformylase  39.87 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00573318  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  44.3 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  41.21 
 
 		 170 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  41.21 
 
 		 170 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  41.21 
 
 		 170 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  41.21 
 
 		 170 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  39.76 
 
 		 170 aa  118  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  41.67 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  39.66 
 
 		 180 aa  117  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  41.88 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  41.88 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  40.36 
 
 		 196 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  39.16 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  39.76 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  40.24 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  43.62 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  44 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  41.07 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  43.84 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  40.12 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  39.16 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0024  peptide deformylase  41.57 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  42.77 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  39.63 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  40.36 
 
 		 168 aa  115  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>