More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1571 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  100 
 
 		 186 aa  381  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  71.19 
 
 		 185 aa  271  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  66.67 
 
 		 188 aa  264  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  66.29 
 
 		 188 aa  255  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  61.29 
 
 		 190 aa  247  6e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  62.9 
 
 		 199 aa  247  6e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  64.2 
 
 		 185 aa  244  4e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  43.24 
 
 		 186 aa  147  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  40.54 
 
 		 189 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  43.48 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  41.08 
 
 		 196 aa  140  9e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  46.15 
 
 		 176 aa  137  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  38.92 
 
 		 196 aa  137  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1904  peptide deformylase  39.25 
 
 		 192 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  41.27 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  45.45 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  45.81 
 
 		 201 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  38.17 
 
 		 194 aa  134  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  44.87 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  45.16 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  39.55 
 
 		 184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  38.89 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  41.42 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  41.42 
 
 		 171 aa  131  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  42.51 
 
 		 182 aa  131  6e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  43.48 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  43.48 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  42.58 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  40.72 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  43.64 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  38.71 
 
 		 196 aa  127  6e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  44.44 
 
 		 188 aa  127  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  39.05 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  41.21 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1326  hypothetical protein  39.13 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.368395 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  43.71 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  40.74 
 
 		 169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  38.41 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  42.58 
 
 		 150 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  40.49 
 
 		 164 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  40.46 
 
 		 178 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  41.21 
 
 		 170 aa  123  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  40.27 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  38.27 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  40.27 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  39.64 
 
 		 171 aa  122  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  41.46 
 
 		 164 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  40.61 
 
 		 170 aa  121  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  36.11 
 
 		 192 aa  121  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  40.36 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  40.24 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  37.72 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  37.72 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  39.76 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  42.51 
 
 		 169 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  42.33 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  38.79 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  43.24 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  41.25 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  37.8 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  42.67 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  42.36 
 
 		 154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  38.89 
 
 		 169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  39.02 
 
 		 162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  39.62 
 
 		 173 aa  118  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  41.78 
 
 		 192 aa  118  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  39.26 
 
 		 179 aa  118  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  40.27 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  35.98 
 
 		 177 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  41.1 
 
 		 172 aa  117  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  35.98 
 
 		 177 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  39.88 
 
 		 175 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  36.52 
 
 		 178 aa  117  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  37.2 
 
 		 177 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  43.05 
 
 		 156 aa  117  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  42.94 
 
 		 176 aa  117  7.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  36.42 
 
 		 187 aa  117  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0438  polypeptide deformylase  39.87 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  37.8 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  37.82 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1493  peptide deformylase  37.72 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.977447  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0600  peptide deformylase  39.87 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  38.69 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  40.46 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  39.88 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  37.65 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  39.63 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  38.46 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  39.07 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  38.89 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  38.89 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  38.42 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  36.21 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  39.51 
 
 		 171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  35.59 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  40.12 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  46 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  35.88 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  38.73 
 
 		 187 aa  114  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  38.1 
 
 		 163 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>