More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1130 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  100 
 
 		 164 aa  333  7e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  97.56 
 
 		 164 aa  327  5.0000000000000004e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  52.73 
 
 		 178 aa  170  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  55.48 
 
 		 170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  51.27 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  50.63 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  48.03 
 
 		 169 aa  151  4e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0191  peptide deformylase  46.45 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0691522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  42.95 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  47.59 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  48.03 
 
 		 178 aa  138  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  49.66 
 
 		 164 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  43.04 
 
 		 164 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  44.65 
 
 		 170 aa  136  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1026  peptide deformylase  47.74 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000768351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  44.44 
 
 		 172 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  45.45 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  43.48 
 
 		 171 aa  134  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33985  Peptide deformylase, organellar  44 
 
 		 240 aa  133  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  44.37 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  39.52 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  40.51 
 
 		 177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  42.5 
 
 		 182 aa  131  5e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  53.24 
 
 		 164 aa  130  6e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  41.88 
 
 		 171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  48.59 
 
 		 153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  41.88 
 
 		 171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  43.86 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  45.39 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  40.37 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  42.57 
 
 		 150 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  41.38 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  39.63 
 
 		 177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  42.24 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  39.63 
 
 		 177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  44.65 
 
 		 175 aa  127  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  48.99 
 
 		 180 aa  127  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  43.36 
 
 		 155 aa  127  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  41.1 
 
 		 187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  41.1 
 
 		 187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  39.52 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  40.37 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  41.32 
 
 		 189 aa  125  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  41.26 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  44.08 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  42.14 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  42.14 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  44.08 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  41.77 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  44.22 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  42.77 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  46 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  42.68 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  44.08 
 
 		 168 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  41.61 
 
 		 171 aa  124  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  40.37 
 
 		 174 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  41.42 
 
 		 189 aa  124  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  43.62 
 
 		 181 aa  124  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  45.07 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  43.33 
 
 		 173 aa  124  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  43.23 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  44.08 
 
 		 177 aa  124  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  43.45 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  41.78 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  43.42 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  41.25 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  41.46 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  40.41 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  41.46 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  47.41 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  44.08 
 
 		 168 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  38.32 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  39.75 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  42.42 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  42.42 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  40.62 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  41.46 
 
 		 175 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  40.36 
 
 		 186 aa  121  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  39.44 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  43.45 
 
 		 173 aa  121  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  37.97 
 
 		 173 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1508  peptide deformylase  40.57 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  42.77 
 
 		 181 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  42.42 
 
 		 177 aa  121  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  40.24 
 
 		 186 aa  121  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  42.86 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  41.51 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  42.47 
 
 		 187 aa  121  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  42.14 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  43.95 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  39.76 
 
 		 193 aa  120  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  39.19 
 
 		 201 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  41.51 
 
 		 167 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  36.94 
 
 		 188 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  43.27 
 
 		 189 aa  120  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  43.45 
 
 		 186 aa  120  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  37.35 
 
 		 187 aa  120  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  41.03 
 
 		 167 aa  120  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2912  peptide deformylase  38.71 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000305712  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  39.02 
 
 		 185 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>