More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2201 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  100 
 
 		 189 aa  385  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1904  peptide deformylase  53.44 
 
 		 192 aa  219  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  54.01 
 
 		 196 aa  200  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  53.3 
 
 		 196 aa  197  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  49.49 
 
 		 196 aa  191  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  52.94 
 
 		 190 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  51.05 
 
 		 186 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  46.11 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  47.09 
 
 		 194 aa  164  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  45.9 
 
 		 189 aa  157  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5119  peptide deformylase  38.38 
 
 		 191 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  41.27 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  40.86 
 
 		 199 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  37.71 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  37.71 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  40 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  38.29 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  40.83 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  37.36 
 
 		 177 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  40.74 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1326  hypothetical protein  40.53 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.368395 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  41.32 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  40.96 
 
 		 168 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  40.33 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  37.14 
 
 		 174 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  40.96 
 
 		 168 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  40.72 
 
 		 164 aa  123  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  39.77 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  40.36 
 
 		 168 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  40.96 
 
 		 168 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  39.56 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  41.92 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  37.93 
 
 		 180 aa  122  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  40.68 
 
 		 178 aa  122  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  39.43 
 
 		 172 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  41.48 
 
 		 178 aa  122  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  39.88 
 
 		 177 aa  121  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  40.98 
 
 		 188 aa  122  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  40.91 
 
 		 165 aa  121  6e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  39.76 
 
 		 168 aa  121  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  41.57 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  39.16 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  39.05 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  38.55 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  36.57 
 
 		 174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1026  peptide deformylase  41.21 
 
 		 168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000768351  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  35.96 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  37.35 
 
 		 168 aa  118  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  38.41 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  35.96 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  38.99 
 
 		 175 aa  118  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  39.16 
 
 		 175 aa  118  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  38.99 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2579  peptide deformylase  38.41 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.231026  hitchhiker  0.00000660539 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  37.58 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0191  peptide deformylase  39.29 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0691522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  37.95 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  37.8 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  37.5 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  35.5 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  35.5 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  39.35 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  36.63 
 
 		 168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  37.5 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  36.63 
 
 		 176 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  35.16 
 
 		 185 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  40 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  38.55 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  37.35 
 
 		 168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  38.1 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  38.1 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  38.69 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  39.47 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  36.63 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  35.75 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  38.1 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  35.2 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  37.5 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  38.1 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  35.5 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  35.76 
 
 		 171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  36.81 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  36.6 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  36.6 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  40.12 
 
 		 170 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  38.1 
 
 		 171 aa  110  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  37.58 
 
 		 170 aa  110  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  40.36 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  37.58 
 
 		 170 aa  110  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  37.91 
 
 		 203 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  37.5 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  37.5 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  38.82 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  33.14 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  39.16 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  37.5 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  37.5 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  38.92 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  36.2 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  36.9 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>