More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0954 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  100 
 
 		 170 aa  350  5.9999999999999994e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  61.15 
 
 		 165 aa  204  7e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  55.48 
 
 		 164 aa  174  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  54.84 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  51.5 
 
 		 178 aa  164  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0191  peptide deformylase  45.86 
 
 		 162 aa  139  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0691522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  45.62 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  42.17 
 
 		 169 aa  137  7e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  43.04 
 
 		 186 aa  130  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  47.92 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  43.45 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  39.05 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  48.89 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  48.89 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  47.89 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  42.35 
 
 		 183 aa  124  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  42.21 
 
 		 186 aa  123  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  45.32 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  44.31 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  47.89 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  39.26 
 
 		 174 aa  121  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1026  peptide deformylase  44.38 
 
 		 168 aa  121  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000768351  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  39.52 
 
 		 179 aa  120  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  40.85 
 
 		 171 aa  120  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  40.35 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  43.83 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  40.91 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  39.78 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  38.46 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  38.64 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  45.77 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  41.42 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  47.62 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  40.37 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  39.41 
 
 		 194 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  39.78 
 
 		 194 aa  117  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  41.51 
 
 		 175 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  37.82 
 
 		 183 aa  117  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  39.67 
 
 		 192 aa  116  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  40.88 
 
 		 175 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  47.52 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  38.55 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  44.17 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  40.24 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  40.83 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  40.25 
 
 		 181 aa  114  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  40.74 
 
 		 204 aa  114  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  39.62 
 
 		 175 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  38.55 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  39.19 
 
 		 169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  38.18 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  42 
 
 		 182 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  39.51 
 
 		 202 aa  114  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  39.51 
 
 		 202 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  39.88 
 
 		 180 aa  114  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  37.95 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  37.95 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  38.51 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  38.24 
 
 		 196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0163  peptide deformylase  36.61 
 
 		 195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33985  Peptide deformylase, organellar  42.31 
 
 		 240 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  38.99 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  43.42 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  40.38 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  41.29 
 
 		 177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  40.69 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  41.29 
 
 		 177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  37.43 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1757  peptide deformylase  48.55 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  39.63 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  37.42 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  39.63 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  37.91 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  40.28 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  41.46 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  37.57 
 
 		 182 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  42.47 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  38.69 
 
 		 178 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  38.18 
 
 		 190 aa  111  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  40.99 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  39.13 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  38.36 
 
 		 175 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  39.16 
 
 		 175 aa  111  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  39.13 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  41.55 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  40.24 
 
 		 171 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  38.16 
 
 		 177 aa  110  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  43.36 
 
 		 191 aa  110  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  44.2 
 
 		 159 aa  110  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  42.03 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  39.31 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  37.13 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  42.76 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  45.04 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  38.79 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  42.75 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3599  peptide deformylase  35.96 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000726362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  39.24 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  36.53 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  39.64 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>