More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06160 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  100 
 
 		 196 aa  402  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  66.33 
 
 		 196 aa  275  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  67.86 
 
 		 196 aa  271  5.000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1904  peptide deformylase  58.85 
 
 		 192 aa  236  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  58.67 
 
 		 186 aa  232  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  60.53 
 
 		 184 aa  227  8e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  56.84 
 
 		 190 aa  224  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  57.22 
 
 		 194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  54.01 
 
 		 189 aa  200  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  45.95 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5119  peptide deformylase  47.37 
 
 		 191 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267223 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  41.62 
 
 		 190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  41.8 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1326  hypothetical protein  41.58 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.368395 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  41.08 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  42.13 
 
 		 180 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  40.64 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  44.69 
 
 		 178 aa  137  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  40.54 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  37.56 
 
 		 188 aa  130  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  36.65 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  37.43 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  37.43 
 
 		 171 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1867  peptide deformylase  42.25 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.743166 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1493  peptide deformylase  38.12 
 
 		 171 aa  121  5e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.977447  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  45.12 
 
 		 194 aa  121  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  38.12 
 
 		 174 aa  121  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  38.67 
 
 		 165 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  37.91 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  39.77 
 
 		 162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  39.13 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0163  peptide deformylase  43.45 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  39.53 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  38.55 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  39.66 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  38.64 
 
 		 164 aa  115  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  36.31 
 
 		 174 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  37.29 
 
 		 184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  37.29 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  36.52 
 
 		 177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  38.64 
 
 		 164 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  36.31 
 
 		 174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  38.42 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  36.72 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  36.36 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  35.9 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  39.78 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  33.33 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  33.33 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  36.87 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  39.41 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  36.36 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  38.89 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  34.95 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  38.55 
 
 		 164 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  37.57 
 
 		 192 aa  110  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  36.16 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  40.65 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  37.71 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  39.53 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  37.78 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  38.76 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  38.27 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  38.37 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  36.14 
 
 		 176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  36.57 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  36.36 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  39.29 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  33.91 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  37.28 
 
 		 167 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  35.54 
 
 		 187 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  39.18 
 
 		 201 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  37.71 
 
 		 187 aa  107  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  38.27 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  38.37 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  38.37 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  37.21 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  38.37 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  39.35 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  34.46 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  37.72 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  36.59 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  33.33 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  33.33 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  38.76 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  37.71 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  36.11 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  37.71 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  33.52 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0043  peptide deformylase  32.97 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.715813  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  36.61 
 
 		 171 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  36.84 
 
 		 167 aa  105  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  36.97 
 
 		 152 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  37.64 
 
 		 167 aa  105  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  37.35 
 
 		 170 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  37.35 
 
 		 170 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  36.31 
 
 		 150 aa  104  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  37.16 
 
 		 178 aa  104  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2233  peptide deformylase  36.99 
 
 		 173 aa  104  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  38.06 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>