More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1788 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  100 
 
 		 188 aa  382  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  72.73 
 
 		 188 aa  274  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  75.57 
 
 		 199 aa  273  7e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  72.73 
 
 		 190 aa  263  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  66.29 
 
 		 186 aa  255  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  66.1 
 
 		 185 aa  254  6e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  67.78 
 
 		 185 aa  251  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  43.48 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  43.48 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  40.43 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  40.88 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  40.74 
 
 		 184 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  46.58 
 
 		 201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  46.58 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  46.58 
 
 		 201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  40.57 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  40.54 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1904  peptide deformylase  38.62 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  44.87 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  46.58 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  42.68 
 
 		 172 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  42.68 
 
 		 172 aa  128  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  43.37 
 
 		 174 aa  127  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  40.48 
 
 		 171 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  39.46 
 
 		 196 aa  127  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  38.92 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  46.58 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  44.79 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  42.17 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  44.79 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  44.44 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  42.86 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  43.56 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  40 
 
 		 182 aa  125  5e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  42.51 
 
 		 177 aa  124  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  42.24 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  41.82 
 
 		 175 aa  124  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  43.05 
 
 		 154 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  40.37 
 
 		 169 aa  121  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  40.98 
 
 		 189 aa  122  5e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  45.64 
 
 		 201 aa  121  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  43.2 
 
 		 178 aa  121  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  39.39 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  39.39 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  42.28 
 
 		 153 aa  120  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  44.23 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  43.14 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  43.14 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  42.58 
 
 		 170 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  42.58 
 
 		 170 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  43.11 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  40.49 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  41.61 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  43.84 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  41.94 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  44.37 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  43.11 
 
 		 170 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  38.6 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  43.87 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  42.95 
 
 		 154 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  42.95 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0163  peptide deformylase  42.07 
 
 		 195 aa  117  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  41.25 
 
 		 167 aa  117  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  41.83 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  40.41 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  42.11 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  40.61 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  44.44 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  41.67 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  39.77 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  42.07 
 
 		 178 aa  116  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  40.79 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  43.37 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1326  hypothetical protein  39.34 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.368395 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  38.79 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  39.86 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  41.46 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  42.42 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  39.76 
 
 		 168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  41.28 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  39.16 
 
 		 171 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  41.36 
 
 		 169 aa  115  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  35.71 
 
 		 170 aa  115  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  42.58 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  42.33 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  39.64 
 
 		 169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  38.41 
 
 		 172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  42.17 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  40.28 
 
 		 167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  40.28 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  42.17 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  41.06 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  38.18 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  43.62 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  42.77 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0038  peptide deformylase  39.39 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.346284 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1493  peptide deformylase  39.6 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.977447  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  37.95 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  40.25 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  40.25 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>