More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0204 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  100 
 
 		 196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  66.33 
 
 		 196 aa  273  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  67.86 
 
 		 196 aa  271  5.000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  57.65 
 
 		 186 aa  223  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  57.67 
 
 		 190 aa  221  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1904  peptide deformylase  55.5 
 
 		 192 aa  214  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  57.37 
 
 		 194 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  52.38 
 
 		 184 aa  201  7e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  49.49 
 
 		 189 aa  191  4e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  47.62 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1326  hypothetical protein  42.63 
 
 		 188 aa  156  1e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.368395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5119  peptide deformylase  44.15 
 
 		 191 aa  148  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267223 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  39.58 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  36.73 
 
 		 199 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  37.3 
 
 		 190 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  38.71 
 
 		 186 aa  127  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  36.84 
 
 		 188 aa  127  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  38.92 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  37.91 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  35.71 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  42.46 
 
 		 178 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  37.84 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  38.2 
 
 		 180 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  38.67 
 
 		 184 aa  122  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  35.96 
 
 		 174 aa  121  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  41.81 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  41.24 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  41.29 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  40 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  37.5 
 
 		 185 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  37.08 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  37.57 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  36.87 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  36.72 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  35.75 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  39.53 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  35.75 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  42.6 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  36.93 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  36.93 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  39.78 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  39.22 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  37.85 
 
 		 171 aa  115  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  37.08 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  36.16 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  36.93 
 
 		 185 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  38.07 
 
 		 169 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  36.59 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  35.03 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  41.29 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  35.03 
 
 		 171 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  41.06 
 
 		 152 aa  111  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  35.71 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  38.12 
 
 		 176 aa  111  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  38.2 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  35.16 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  36.96 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0031  peptide deformylase  39.23 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  38.2 
 
 		 167 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  33.9 
 
 		 171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  38.37 
 
 		 169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  38.51 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  36.05 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  36.36 
 
 		 164 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  37.21 
 
 		 172 aa  109  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  38.04 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  34.08 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  38.65 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1867  peptide deformylase  35.64 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.743166 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  37.7 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  37.21 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  36.63 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  38.95 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0163  peptide deformylase  43.03 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  36.09 
 
 		 167 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  34.08 
 
 		 177 aa  107  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1493  peptide deformylase  33.89 
 
 		 171 aa  108  7.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.977447  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  38.46 
 
 		 170 aa  107  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  38.46 
 
 		 170 aa  107  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  35.47 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  34.1 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0038  peptide deformylase  37.02 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.346284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  36.63 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  37.21 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  36.72 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  35.8 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  35.47 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  37.21 
 
 		 168 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  37.57 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  32.78 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  37.21 
 
 		 168 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  38.01 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  32.78 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  36.53 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  40.24 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  34.46 
 
 		 172 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  37.43 
 
 		 177 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  37.02 
 
 		 168 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  35.59 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  42 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>