More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3323 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  100 
 
 		 182 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  56.73 
 
 		 181 aa  214  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  59.51 
 
 		 176 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  57.06 
 
 		 179 aa  207  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  53.49 
 
 		 177 aa  206  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  57.41 
 
 		 178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  56.79 
 
 		 178 aa  197  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  53.76 
 
 		 182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  50.28 
 
 		 190 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0900  peptide deformylase  51.88 
 
 		 176 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000606626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3037  peptide deformylase  51.25 
 
 		 181 aa  170  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308072  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  54.97 
 
 		 181 aa  168  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1062  polypeptide deformylase  52.5 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0937  peptide deformylase  50.62 
 
 		 181 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000269089  normal  0.0932727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0886  peptide deformylase  54.97 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000428038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3476  peptide deformylase  54.97 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00071133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3599  peptide deformylase  54.3 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000726362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3401  peptide deformylase  54.3 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000135447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  40.23 
 
 		 188 aa  154  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0639  peptide deformylase  49.03 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000242683  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  48.34 
 
 		 170 aa  142  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2912  peptide deformylase  44.87 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000305712  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  40.51 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  42.18 
 
 		 177 aa  124  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  38.15 
 
 		 207 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  41.22 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  41.72 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  42.76 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  44.27 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  43.45 
 
 		 179 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  41.72 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  41.5 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  41.5 
 
 		 177 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  40.97 
 
 		 177 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  41.5 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  39.86 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  39.6 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  40.94 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  41.98 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  40.82 
 
 		 177 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  39.46 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  40.54 
 
 		 177 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  41.84 
 
 		 178 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  42.36 
 
 		 177 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  42.36 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  40.28 
 
 		 177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  38.56 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  37.75 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  40.69 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  43.51 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  42.36 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  39.75 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  43.51 
 
 		 178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  40.91 
 
 		 189 aa  111  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  42.07 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  42.07 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  39.58 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  39.58 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  39.58 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  38.89 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  39.58 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  39.58 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  41.98 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  37.5 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  38.51 
 
 		 196 aa  108  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  38.89 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  38.89 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  35.95 
 
 		 171 aa  108  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  37.5 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  40.97 
 
 		 177 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  40.97 
 
 		 177 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  40.97 
 
 		 177 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  40.28 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  37.42 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  36.88 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  38.36 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  37.84 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  37.58 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  40.28 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  37.5 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  40.54 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  38.62 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  34.32 
 
 		 201 aa  104  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  43.06 
 
 		 178 aa  104  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  42 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  36.55 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  34.32 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  38.16 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  42.07 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  36.08 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  35.29 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  34.48 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  36.14 
 
 		 192 aa  101  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  36.31 
 
 		 167 aa  101  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  36.18 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  36.73 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  33.54 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  37.09 
 
 		 154 aa  100  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  32.95 
 
 		 187 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  35.15 
 
 		 194 aa  100  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>