More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2912 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2912  peptide deformylase  100 
 
 		 168 aa  343  8e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000305712  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3037  peptide deformylase  58.97 
 
 		 181 aa  194  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308072  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3401  peptide deformylase  59.21 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000135447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  61.59 
 
 		 181 aa  194  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3599  peptide deformylase  58.55 
 
 		 185 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000726362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0886  peptide deformylase  58.55 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000428038  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0937  peptide deformylase  58.33 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000269089  normal  0.0932727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3476  peptide deformylase  57.89 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00071133  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1062  polypeptide deformylase  58.94 
 
 		 181 aa  190  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  57.59 
 
 		 170 aa  188  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0900  peptide deformylase  57.05 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000606626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0639  peptide deformylase  49.37 
 
 		 174 aa  157  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000242683  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  47.1 
 
 		 179 aa  151  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  44.87 
 
 		 182 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  45.62 
 
 		 176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  44.44 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  43.67 
 
 		 190 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  44.44 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  43.23 
 
 		 177 aa  134  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  42.48 
 
 		 181 aa  134  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  42.86 
 
 		 182 aa  130  6.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  43.59 
 
 		 188 aa  123  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  39.87 
 
 		 178 aa  120  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  38.71 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  37.42 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  40 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  37.89 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  35.54 
 
 		 188 aa  103  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  34.21 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  34.21 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  35.67 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  33.96 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  33.99 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  37.58 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  38.71 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  36.31 
 
 		 170 aa  101  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  34.13 
 
 		 180 aa  101  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  37.09 
 
 		 173 aa  101  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  38.62 
 
 		 204 aa  100  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  34.64 
 
 		 187 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  39.72 
 
 		 179 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  39.72 
 
 		 179 aa  99.8  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  40.71 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  40.71 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  34.34 
 
 		 213 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  34.64 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  40.67 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  35.22 
 
 		 186 aa  99.4  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  37.11 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  34.76 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  36.67 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  32.93 
 
 		 194 aa  98.2  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  35.03 
 
 		 179 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  39.72 
 
 		 177 aa  97.8  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  37.84 
 
 		 177 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0873  N-formylmethionyl tRNA deformylase  38.96 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  33.96 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  35.85 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  36.49 
 
 		 181 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  38.22 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  37.25 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  33.33 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  36.67 
 
 		 181 aa  95.5  3e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  36.43 
 
 		 177 aa  95.5  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  35.37 
 
 		 177 aa  95.5  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  40.71 
 
 		 171 aa  95.1  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  36.36 
 
 		 177 aa  95.1  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  36.43 
 
 		 177 aa  95.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2533  peptide deformylase  38.96 
 
 		 163 aa  94.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.123304  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  40.43 
 
 		 179 aa  94.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  34.01 
 
 		 175 aa  94.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  33.96 
 
 		 177 aa  94.7  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  34.59 
 
 		 180 aa  94.7  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0191  peptide deformylase  32.28 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0691522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  35.06 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  36.42 
 
 		 189 aa  94  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  36.88 
 
 		 177 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  32.08 
 
 		 184 aa  94  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  35.62 
 
 		 181 aa  94  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  36.88 
 
 		 177 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  34.38 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  32.28 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  33.33 
 
 		 190 aa  93.6  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  36.48 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  32.73 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  34.59 
 
 		 177 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0149  peptide deformylase  39.46 
 
 		 163 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.213769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  40.65 
 
 		 178 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1904  peptide deformylase  33.33 
 
 		 192 aa  92.8  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  33.72 
 
 		 192 aa  92  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  36.84 
 
 		 187 aa  92  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  33.96 
 
 		 177 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  35.03 
 
 		 178 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0222  peptide deformylase  38.03 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  33.96 
 
 		 177 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  35.26 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0184  peptide deformylase  38.03 
 
 		 175 aa  91.7  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.55747  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0201  peptide deformylase  38.03 
 
 		 175 aa  91.7  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  37.27 
 
 		 190 aa  91.7  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  33.11 
 
 		 177 aa  91.3  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>