More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4855 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  100 
 
 		 179 aa  367  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  77.65 
 
 		 179 aa  296  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  77.09 
 
 		 179 aa  294  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  77.09 
 
 		 186 aa  284  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  73.18 
 
 		 179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  73.18 
 
 		 179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  74.19 
 
 		 186 aa  266  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  72.63 
 
 		 179 aa  262  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  69.66 
 
 		 177 aa  251  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  67.23 
 
 		 177 aa  247  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  68.36 
 
 		 177 aa  247  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  67.23 
 
 		 177 aa  244  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  66.1 
 
 		 177 aa  244  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  67.23 
 
 		 177 aa  244  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  71.51 
 
 		 178 aa  244  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  66.67 
 
 		 177 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  64.97 
 
 		 177 aa  241  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  69.83 
 
 		 200 aa  240  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  64.61 
 
 		 177 aa  240  7e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  63.28 
 
 		 177 aa  238  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  64.97 
 
 		 177 aa  237  8e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  63.28 
 
 		 177 aa  236  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  63.28 
 
 		 177 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  63.28 
 
 		 177 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  63.28 
 
 		 177 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  63.28 
 
 		 177 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  63.28 
 
 		 177 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  62.71 
 
 		 177 aa  234  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  62.71 
 
 		 177 aa  234  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  63.84 
 
 		 177 aa  234  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  66.67 
 
 		 204 aa  233  9e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  61.8 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  67.25 
 
 		 177 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  65.54 
 
 		 177 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  65.54 
 
 		 177 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  65.54 
 
 		 177 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  66.1 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  64.97 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  64.91 
 
 		 174 aa  224  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  62.36 
 
 		 177 aa  220  8e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  58.43 
 
 		 178 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  60.89 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  60.89 
 
 		 179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  59.55 
 
 		 178 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  58.43 
 
 		 178 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  58.99 
 
 		 178 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  58.1 
 
 		 179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  57.54 
 
 		 179 aa  210  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  57.54 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  56.29 
 
 		 171 aa  194  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  52.07 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  46.43 
 
 		 169 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  46.24 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  45.51 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  46.75 
 
 		 178 aa  130  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  42.76 
 
 		 190 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  39.29 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  41.22 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  39.35 
 
 		 178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  37.97 
 
 		 181 aa  117  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  43.84 
 
 		 170 aa  117  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  40.26 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  39.35 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  37.71 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  42.07 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  37.11 
 
 		 172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  37.18 
 
 		 172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  37.99 
 
 		 164 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  43.21 
 
 		 190 aa  107  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  43.33 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  36.97 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  42.11 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  39.35 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  41.36 
 
 		 183 aa  104  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2912  peptide deformylase  41.13 
 
 		 168 aa  104  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000305712  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0639  peptide deformylase  44.68 
 
 		 174 aa  104  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000242683  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  39.61 
 
 		 170 aa  104  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  39.61 
 
 		 170 aa  104  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  38.71 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  35.95 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  40.37 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  41.88 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  42.77 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  44.16 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  43.83 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0222  peptide deformylase  38.71 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0184  peptide deformylase  38.71 
 
 		 175 aa  101  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.55747  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0201  peptide deformylase  38.71 
 
 		 175 aa  101  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  39.87 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  42.86 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2610  Peptide deformylase  43.95 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  42.07 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  40.74 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  39.31 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  36.63 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  41.29 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  42.21 
 
 		 221 aa  99.8  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  41.77 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  41.46 
 
 		 190 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  38.06 
 
 		 168 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>