More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2610 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2610  Peptide deformylase  100 
 
 		 230 aa  449  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29330  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  57.35 
 
 		 211 aa  206  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3103  peptide deformylase  59.11 
 
 		 217 aa  200  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1147  peptide deformylase  52.58 
 
 		 217 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1935  peptide deformylase  51.94 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000939667 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0620  peptide deformylase  55.12 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2193  peptide deformylase  51.71 
 
 		 226 aa  191  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00150941  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0944  peptide deformylase  47.89 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0664  Peptide deformylase  53.14 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106067  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  45.14 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35850  Peptide deformylase, mitochondrial  45.45 
 
 		 274 aa  138  8.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  48.24 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12740  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  47.98 
 
 		 240 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.869353  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  43.59 
 
 		 177 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  38.75 
 
 		 181 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  41.03 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  42.68 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  41.03 
 
 		 177 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  41.18 
 
 		 177 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  39.74 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  43.14 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  40 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  43.14 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  40.38 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  43.14 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  43.14 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  41.4 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  41.18 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  42.48 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  43.14 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  42.48 
 
 		 177 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  42.48 
 
 		 177 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  42.48 
 
 		 177 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  41.18 
 
 		 177 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  38.01 
 
 		 177 aa  105  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  43.79 
 
 		 186 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  40.13 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  39.51 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  41.18 
 
 		 179 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  41.18 
 
 		 179 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  39.26 
 
 		 180 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  40.52 
 
 		 177 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  43.95 
 
 		 179 aa  101  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  42.68 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  42.86 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  39.1 
 
 		 177 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  38.75 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  39.24 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  36.54 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  39.87 
 
 		 179 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  38.93 
 
 		 178 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  41.04 
 
 		 178 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  37.58 
 
 		 178 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  41.04 
 
 		 178 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  38.99 
 
 		 177 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1326  hypothetical protein  38.27 
 
 		 188 aa  97.4  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.368395 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  38.78 
 
 		 169 aa  97.1  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  36.08 
 
 		 181 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  42.22 
 
 		 195 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  42.48 
 
 		 177 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  36.36 
 
 		 172 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  35.67 
 
 		 179 aa  95.1  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  36.48 
 
 		 168 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  36.48 
 
 		 168 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  39.07 
 
 		 181 aa  94.4  1e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  36.88 
 
 		 179 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  39.74 
 
 		 171 aa  94.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  37.44 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  36.11 
 
 		 188 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  41.83 
 
 		 177 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  43.31 
 
 		 179 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  37.74 
 
 		 174 aa  94  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  34.78 
 
 		 196 aa  92  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  40.52 
 
 		 177 aa  91.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  36.31 
 
 		 179 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  40.52 
 
 		 177 aa  91.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  40.52 
 
 		 177 aa  91.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  33.96 
 
 		 168 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  35.67 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  38.89 
 
 		 164 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  34.59 
 
 		 168 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  36.21 
 
 		 199 aa  90.9  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1493  peptide deformylase  32.48 
 
 		 171 aa  90.5  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.977447  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  37.34 
 
 		 181 aa  89.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  38.04 
 
 		 190 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  35.19 
 
 		 190 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1904  peptide deformylase  36.2 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  37.58 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  35.4 
 
 		 196 aa  89.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  37.74 
 
 		 189 aa  89.4  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  36.48 
 
 		 168 aa  89.4  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5119  peptide deformylase  35 
 
 		 191 aa  88.6  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267223 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  39.39 
 
 		 209 aa  88.6  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  31.25 
 
 		 182 aa  88.6  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  33.33 
 
 		 187 aa  88.6  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  33.33 
 
 		 187 aa  88.6  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  35.62 
 
 		 170 aa  88.2  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  40.38 
 
 		 178 aa  87.8  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  37.2 
 
 		 188 aa  88.2  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  34.18 
 
 		 171 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>