More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1399 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  100 
 
 		 177 aa  364  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  93.79 
 
 		 177 aa  347  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  93.22 
 
 		 177 aa  345  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  82.49 
 
 		 177 aa  303  9.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  79.1 
 
 		 177 aa  296  8e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  75.29 
 
 		 177 aa  270  7e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  70.06 
 
 		 177 aa  265  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  70.06 
 
 		 177 aa  264  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  71.19 
 
 		 177 aa  261  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  68.93 
 
 		 177 aa  259  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  69.49 
 
 		 177 aa  259  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  69.49 
 
 		 177 aa  257  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  69.59 
 
 		 177 aa  256  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  68.36 
 
 		 177 aa  255  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  68.36 
 
 		 177 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  68.36 
 
 		 177 aa  255  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  68.36 
 
 		 177 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  68.36 
 
 		 177 aa  255  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  70.59 
 
 		 174 aa  254  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  67.8 
 
 		 177 aa  254  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  67.8 
 
 		 177 aa  254  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  68.93 
 
 		 179 aa  251  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  67.86 
 
 		 177 aa  248  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  68.36 
 
 		 179 aa  248  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  70.41 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  66.48 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  65.71 
 
 		 178 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  67.05 
 
 		 178 aa  241  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  68.93 
 
 		 177 aa  240  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  68.93 
 
 		 177 aa  240  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  68.93 
 
 		 177 aa  240  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  66.48 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  69.49 
 
 		 177 aa  239  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  69.49 
 
 		 177 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  71.02 
 
 		 178 aa  239  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  64.8 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  68.93 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  68.93 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  64.16 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  66.47 
 
 		 178 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  65.32 
 
 		 178 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  63.95 
 
 		 181 aa  234  5.0000000000000005e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  63.58 
 
 		 179 aa  233  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  66.67 
 
 		 200 aa  231  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  64.41 
 
 		 186 aa  230  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  64.29 
 
 		 177 aa  226  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  67.8 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  66.85 
 
 		 186 aa  225  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  64.97 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  61.99 
 
 		 171 aa  221  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  51.22 
 
 		 181 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  51.46 
 
 		 207 aa  167  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  49.69 
 
 		 169 aa  155  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  47.53 
 
 		 176 aa  144  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  41.18 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  39.61 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  40 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  38.31 
 
 		 179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  43.71 
 
 		 178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  40.48 
 
 		 209 aa  117  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  37.34 
 
 		 172 aa  117  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  39.47 
 
 		 190 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  40.94 
 
 		 208 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  45.81 
 
 		 190 aa  114  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  40.54 
 
 		 182 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  42.47 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  40.13 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  37.91 
 
 		 178 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  37.91 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  38.6 
 
 		 170 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  42.77 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  40.67 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  40.25 
 
 		 168 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  42.38 
 
 		 167 aa  107  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  40.67 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  40.25 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  41.33 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  42.31 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  43.75 
 
 		 167 aa  104  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  39.19 
 
 		 184 aa  104  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  44 
 
 		 168 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  43.12 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  40.91 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  38 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  42.24 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  38.99 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3401  peptide deformylase  41.78 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000135447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  40.88 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3599  peptide deformylase  41.1 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000726362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  34.19 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3476  peptide deformylase  41.1 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00071133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  38.73 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0886  peptide deformylase  41.1 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000428038  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  40.99 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  40.67 
 
 		 170 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  40.67 
 
 		 170 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35850  Peptide deformylase, mitochondrial  36.96 
 
 		 274 aa  102  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  43.33 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  37.84 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>