More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4446 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  98.88 
 
 
178 aa  366  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  100 
 
 
178 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  67.48 
 
 
176 aa  235  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  65.41 
 
 
177 aa  221  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  61.31 
 
 
179 aa  217  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  59.06 
 
 
190 aa  215  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  60.74 
 
 
181 aa  214  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  56.79 
 
 
182 aa  197  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  53.99 
 
 
182 aa  194  5.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  51.55 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0900  peptide deformylase  53.12 
 
 
176 aa  165  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000606626  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3599  peptide deformylase  49.4 
 
 
185 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000726362  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3476  peptide deformylase  48.81 
 
 
185 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00071133  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0886  peptide deformylase  48.81 
 
 
185 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000428038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3401  peptide deformylase  48.21 
 
 
185 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000135447  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3037  peptide deformylase  49.38 
 
 
181 aa  154  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308072  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1062  polypeptide deformylase  50.62 
 
 
181 aa  154  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  48.77 
 
 
181 aa  154  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  50.65 
 
 
170 aa  150  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0937  peptide deformylase  48.12 
 
 
181 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000269089  normal  0.0932727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0639  peptide deformylase  51.66 
 
 
174 aa  144  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000242683  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2912  peptide deformylase  44.44 
 
 
168 aa  135  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000305712  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  42.48 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  38.56 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  40.88 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  40.22 
 
 
187 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  37.91 
 
 
177 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  39.22 
 
 
177 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  39.1 
 
 
181 aa  115  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  39.87 
 
 
187 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  39.87 
 
 
187 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  38.56 
 
 
177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  37.91 
 
 
177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  37.66 
 
 
186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  37.25 
 
 
177 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  36.13 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  37.91 
 
 
177 aa  111  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  35.71 
 
 
177 aa  111  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  36.6 
 
 
177 aa  111  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  39.35 
 
 
179 aa  111  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  38.93 
 
 
169 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  38.06 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  35.95 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  38.06 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  37.08 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  40.46 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  38.99 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  34.64 
 
 
177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  35.29 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  37.74 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  35.95 
 
 
177 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  37.01 
 
 
179 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  38.56 
 
 
152 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  37.5 
 
 
181 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  38.06 
 
 
179 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  37.42 
 
 
190 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  34.16 
 
 
201 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  34.64 
 
 
177 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  40.99 
 
 
189 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  38.56 
 
 
154 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  35.71 
 
 
179 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  34.64 
 
 
177 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  34.64 
 
 
177 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  34.64 
 
 
177 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  35.95 
 
 
177 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  40.26 
 
 
178 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  34.64 
 
 
171 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  34.64 
 
 
177 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  34.64 
 
 
177 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  37.16 
 
 
164 aa  105  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  38.51 
 
 
201 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  35.95 
 
 
204 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  34.88 
 
 
207 aa  105  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4432  peptide deformylase  38.92 
 
 
211 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  37.5 
 
 
153 aa  105  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  33.99 
 
 
177 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  33.99 
 
 
177 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  37.16 
 
 
164 aa  103  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  36.6 
 
 
150 aa  103  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  38.06 
 
 
178 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  37.91 
 
 
170 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  33.75 
 
 
201 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  34.91 
 
 
202 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  35.85 
 
 
187 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  38.56 
 
 
178 aa  102  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  36.99 
 
 
169 aa  102  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  36.6 
 
 
177 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  34.91 
 
 
189 aa  102  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  35.06 
 
 
174 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  36.84 
 
 
188 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  37.25 
 
 
177 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  35.26 
 
 
178 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  37.25 
 
 
177 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  37.25 
 
 
177 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  33.33 
 
 
201 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  33.73 
 
 
202 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  37.27 
 
 
167 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  37.89 
 
 
167 aa  101  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  35.95 
 
 
169 aa  101  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  36.99 
 
 
199 aa  101  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>