More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0374 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  100 
 
 		 209 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  56.65 
 
 		 176 aa  189  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  57.76 
 
 		 169 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  50 
 
 		 207 aa  164  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  44.97 
 
 		 177 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  44.05 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  40.8 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  40.11 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  41.76 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  40.51 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  39.08 
 
 		 179 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  39.08 
 
 		 179 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  39.88 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  41.07 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  41.76 
 
 		 177 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  40.85 
 
 		 177 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  44.13 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  39.08 
 
 		 176 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  40.23 
 
 		 179 aa  121  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  40.24 
 
 		 177 aa  121  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  40 
 
 		 177 aa  121  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  39.88 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  40 
 
 		 177 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  40.59 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  38.29 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  45.1 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  39.08 
 
 		 178 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  40.24 
 
 		 177 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  40 
 
 		 177 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  40.61 
 
 		 178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  39.51 
 
 		 164 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  39.41 
 
 		 177 aa  117  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  40.48 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  40.48 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  38.42 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  40.48 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  40.48 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  40.48 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  40.48 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  36.57 
 
 		 179 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  40.48 
 
 		 177 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  38.51 
 
 		 178 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  40.48 
 
 		 177 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  38.89 
 
 		 152 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  39.66 
 
 		 179 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  41.76 
 
 		 186 aa  115  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  40.24 
 
 		 171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  45.62 
 
 		 154 aa  114  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  41.18 
 
 		 177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  39.75 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  39.88 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  39.2 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  43.04 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  36.26 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  40.57 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  43.04 
 
 		 155 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  41.28 
 
 		 167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  41.42 
 
 		 177 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  42.14 
 
 		 150 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  38.42 
 
 		 181 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  37.97 
 
 		 154 aa  111  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  38.51 
 
 		 178 aa  111  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  42.86 
 
 		 181 aa  111  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  37.74 
 
 		 178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  41.38 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  42.33 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  39.88 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  39.64 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  39.64 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  39.64 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  37.74 
 
 		 178 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  39.23 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  39.26 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  39.78 
 
 		 185 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  37.66 
 
 		 181 aa  106  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  43.64 
 
 		 185 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  39.35 
 
 		 153 aa  105  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  38.33 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  37.64 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  39.43 
 
 		 179 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  35.85 
 
 		 177 aa  105  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  42.41 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  37.71 
 
 		 179 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  41.51 
 
 		 182 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  42.86 
 
 		 180 aa  104  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  37.42 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  41.14 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  37.79 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  43.45 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  35.63 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  38.61 
 
 		 167 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  40.76 
 
 		 159 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  40.56 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  37.78 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  39.61 
 
 		 147 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  40.51 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  41.82 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3474  peptide deformylase  38.27 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  39.2 
 
 		 163 aa  102  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  38.61 
 
 		 167 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>