More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2590 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  100 
 
 		 179 aa  364  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  86.03 
 
 		 179 aa  325  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  80.45 
 
 		 179 aa  283  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  74.3 
 
 		 179 aa  276  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  74.3 
 
 		 179 aa  276  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  73.74 
 
 		 186 aa  275  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  75.81 
 
 		 186 aa  275  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  77.65 
 
 		 179 aa  275  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  74.01 
 
 		 177 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  74.01 
 
 		 177 aa  270  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  72.88 
 
 		 177 aa  265  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  72.47 
 
 		 177 aa  263  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  71.75 
 
 		 177 aa  261  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  71.19 
 
 		 177 aa  259  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  68.36 
 
 		 177 aa  257  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  68.93 
 
 		 177 aa  253  8e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  68.93 
 
 		 177 aa  253  8e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  68.93 
 
 		 177 aa  253  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  68.93 
 
 		 177 aa  253  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  68.93 
 
 		 177 aa  253  8e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  67.8 
 
 		 177 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  68.36 
 
 		 177 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  68.36 
 
 		 177 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  67.23 
 
 		 177 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  73.74 
 
 		 178 aa  251  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  68.93 
 
 		 177 aa  251  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  72.07 
 
 		 200 aa  249  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  66.1 
 
 		 177 aa  248  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  67.8 
 
 		 177 aa  248  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  65.17 
 
 		 177 aa  244  4e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  65.73 
 
 		 178 aa  244  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  65.17 
 
 		 178 aa  240  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  65.17 
 
 		 178 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  66.47 
 
 		 204 aa  239  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  66.48 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  66.29 
 
 		 174 aa  238  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  64 
 
 		 181 aa  238  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  64.04 
 
 		 178 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  67.8 
 
 		 177 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  67.8 
 
 		 177 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  64.8 
 
 		 179 aa  235  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  67.8 
 
 		 177 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  67.23 
 
 		 177 aa  234  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  66.67 
 
 		 177 aa  233  9e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  67.23 
 
 		 177 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  68.02 
 
 		 177 aa  230  7.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  60.89 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  60.89 
 
 		 179 aa  227  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  62.57 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  58.68 
 
 		 171 aa  204  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  52.07 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  46.2 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  47.31 
 
 		 169 aa  145  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  47.34 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  42.51 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  39.53 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  40.91 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  39.74 
 
 		 172 aa  120  9e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  43.45 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  38.29 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  40.38 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  40.4 
 
 		 190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  38.96 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  40 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  42.77 
 
 		 170 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  42.48 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  42.48 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  45.22 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  39.35 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  43.23 
 
 		 168 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  44.17 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  43.45 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  37.01 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  41.36 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  42.41 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  43.95 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  41.94 
 
 		 168 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  42.58 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  42.58 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  37.01 
 
 		 178 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  41.98 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  39.35 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  44.16 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  40.52 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  42.42 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  39.87 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  39.35 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  42.86 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  38.41 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  42.48 
 
 		 178 aa  104  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  37.13 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  40.52 
 
 		 168 aa  104  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  41.83 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  41.83 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  41.98 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  42.04 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  37.01 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>