More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3633 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  100 
 
 		 174 aa  347  7e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  75.14 
 
 		 177 aa  264  5e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  72.35 
 
 		 177 aa  259  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  71.76 
 
 		 177 aa  258  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  70.59 
 
 		 177 aa  254  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  70.93 
 
 		 204 aa  251  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  70 
 
 		 177 aa  250  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  68.24 
 
 		 177 aa  249  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  66.29 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  67.63 
 
 		 178 aa  238  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  63.74 
 
 		 177 aa  237  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  66.47 
 
 		 178 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  67.05 
 
 		 178 aa  235  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  63.74 
 
 		 177 aa  235  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  65.9 
 
 		 178 aa  233  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  67.63 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  65.32 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  68.21 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  63.58 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  63.74 
 
 		 177 aa  231  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  64.33 
 
 		 177 aa  229  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  63.53 
 
 		 177 aa  229  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  67.82 
 
 		 178 aa  228  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  65.12 
 
 		 186 aa  226  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  63.74 
 
 		 177 aa  225  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  62.29 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  64.33 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  64.33 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  64.33 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  64.33 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  64.33 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  64.16 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  63.74 
 
 		 177 aa  223  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  63.74 
 
 		 177 aa  223  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  60.57 
 
 		 181 aa  221  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  63.53 
 
 		 177 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  64.74 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  64.74 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  60.23 
 
 		 177 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  59.65 
 
 		 177 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  66.86 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  65.9 
 
 		 200 aa  214  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  64.84 
 
 		 186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  63.79 
 
 		 179 aa  210  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  60 
 
 		 171 aa  207  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  60.23 
 
 		 177 aa  201  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  60.23 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  60.23 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  60.23 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  59.65 
 
 		 177 aa  197  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  52.41 
 
 		 181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  49.13 
 
 		 207 aa  157  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  51.01 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  43.04 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  44.05 
 
 		 209 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  46.75 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  43.04 
 
 		 172 aa  130  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  44.05 
 
 		 176 aa  130  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  39.33 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  40.4 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  37.28 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  40.27 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  39.47 
 
 		 168 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  39.47 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  42.95 
 
 		 181 aa  107  9.000000000000001e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  37.75 
 
 		 181 aa  107  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  39.39 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  41.67 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  42.31 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  38.82 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  40.13 
 
 		 163 aa  104  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  41.1 
 
 		 168 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  36.02 
 
 		 168 aa  104  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  36.02 
 
 		 168 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  39.1 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  40.99 
 
 		 190 aa  103  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  39.41 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  42.95 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  39.47 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  40.49 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  34.78 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  44.44 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  35.06 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  36.31 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  40.49 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  40.79 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  40.38 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  41.77 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  39.51 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  40.49 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  38.13 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  36.05 
 
 		 182 aa  100  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  40.13 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  40.13 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  38.46 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  35.06 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  43.4 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  36.02 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  40.99 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  39.74 
 
 		 186 aa  99.4  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>