More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_49870 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  100 
 
 		 179 aa  360  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  92.18 
 
 		 179 aa  333  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  79.33 
 
 		 178 aa  294  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  81.56 
 
 		 179 aa  294  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  78.21 
 
 		 179 aa  292  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  79.33 
 
 		 179 aa  291  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  78.65 
 
 		 178 aa  288  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  78.65 
 
 		 178 aa  286  8e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  78.09 
 
 		 178 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  73.74 
 
 		 177 aa  267  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  72.07 
 
 		 177 aa  267  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  72.07 
 
 		 177 aa  265  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  66.48 
 
 		 177 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  69.27 
 
 		 177 aa  252  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  68.72 
 
 		 177 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  70.76 
 
 		 204 aa  250  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  68.72 
 
 		 177 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  68.72 
 
 		 177 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  68.72 
 
 		 177 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  68.72 
 
 		 177 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  68.72 
 
 		 177 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  68.16 
 
 		 177 aa  249  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  68.16 
 
 		 177 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  68.16 
 
 		 177 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  66.48 
 
 		 177 aa  248  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  65.92 
 
 		 177 aa  247  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  68.36 
 
 		 177 aa  247  8e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  67.6 
 
 		 177 aa  246  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  66.48 
 
 		 177 aa  244  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  68.72 
 
 		 177 aa  237  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  68.72 
 
 		 177 aa  237  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  68.72 
 
 		 177 aa  237  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  66.48 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  64.53 
 
 		 181 aa  236  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  64.8 
 
 		 179 aa  235  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  66.47 
 
 		 171 aa  234  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  66.48 
 
 		 177 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  67.63 
 
 		 174 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  65.92 
 
 		 186 aa  230  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  65.36 
 
 		 177 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  64.25 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  64.25 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  67.04 
 
 		 200 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  64.04 
 
 		 178 aa  220  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  62.15 
 
 		 177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  69.27 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  65.59 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  58.14 
 
 		 177 aa  207  9e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  60.89 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  59.41 
 
 		 177 aa  202  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  49.4 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  51.97 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  46.24 
 
 		 207 aa  148  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  48.19 
 
 		 176 aa  134  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  44.24 
 
 		 178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  41.03 
 
 		 190 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  38.56 
 
 		 181 aa  120  9e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  40.91 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  43.29 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  39.26 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  37.34 
 
 		 172 aa  117  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  39.87 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  40.13 
 
 		 170 aa  117  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  38.51 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  37.27 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  38.71 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  38.65 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  39.66 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  40.94 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  37.89 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  37.27 
 
 		 168 aa  115  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  40.61 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  38.51 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  36.67 
 
 		 188 aa  111  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  35.9 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  42.11 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  42.11 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  39.88 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  37.65 
 
 		 167 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  38.06 
 
 		 178 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  37.8 
 
 		 208 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0017  peptide deformylase  39.74 
 
 		 181 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.746118  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  38.89 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  38.82 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  39.26 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  38.06 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  39.51 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  38.65 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  38.65 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  40.27 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  39.6 
 
 		 171 aa  104  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0639  peptide deformylase  42 
 
 		 174 aa  103  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000242683  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  38.26 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  38.64 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  40.62 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  36.75 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3599  peptide deformylase  45.97 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000726362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0900  peptide deformylase  40.76 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000606626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  38.18 
 
 		 189 aa  101  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2219  peptide deformylase  36.42 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.025374  normal  0.833863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>