More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0029 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  100 
 
 		 171 aa  343  6e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2039  peptide deformylase  80.24 
 
 		 184 aa  270  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0013  peptide deformylase  79.52 
 
 		 169 aa  239  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  57.83 
 
 		 167 aa  203  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  58.58 
 
 		 170 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  53.8 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  49.1 
 
 		 184 aa  160  7e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  48.5 
 
 		 184 aa  158  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  50 
 
 		 167 aa  157  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  48.24 
 
 		 176 aa  154  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  47.59 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  47.59 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  48.45 
 
 		 167 aa  151  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  49.04 
 
 		 172 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  49.38 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  52.15 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  52.15 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  45.24 
 
 		 171 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  45.24 
 
 		 171 aa  148  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  46.71 
 
 		 174 aa  148  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  47.88 
 
 		 168 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  49.69 
 
 		 167 aa  147  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  50 
 
 		 170 aa  147  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  47.62 
 
 		 171 aa  147  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  47.88 
 
 		 168 aa  147  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  48.8 
 
 		 170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  49.38 
 
 		 169 aa  145  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  47.88 
 
 		 172 aa  145  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3216  peptide deformylase  50.92 
 
 		 166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0170058  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  44.64 
 
 		 171 aa  144  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  45.51 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  48.77 
 
 		 169 aa  144  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  47.27 
 
 		 172 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  46.78 
 
 		 177 aa  143  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  46.3 
 
 		 168 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  46.01 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  47.85 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  47.85 
 
 		 216 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  42.35 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  42.35 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  47.85 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  46.01 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  46.06 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  50 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  47.24 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  47.24 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  46.25 
 
 		 191 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  47.85 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  44.12 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  46.06 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  50 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  50 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  50 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  50 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  50 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  47.85 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  47.85 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  46.47 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  45.29 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  48.78 
 
 		 170 aa  142  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  47.85 
 
 		 167 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  47.85 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  45.68 
 
 		 168 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  45.68 
 
 		 168 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  47.85 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  50 
 
 		 169 aa  141  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  45.91 
 
 		 172 aa  141  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  46.63 
 
 		 167 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  49.4 
 
 		 169 aa  141  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  47.31 
 
 		 172 aa  141  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  46.63 
 
 		 167 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  46.63 
 
 		 167 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  49.4 
 
 		 169 aa  140  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  49.4 
 
 		 169 aa  140  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  49.4 
 
 		 169 aa  140  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  49.4 
 
 		 169 aa  140  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  49.4 
 
 		 169 aa  140  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  49.4 
 
 		 169 aa  140  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  45.29 
 
 		 171 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  46.43 
 
 		 175 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  49.4 
 
 		 169 aa  140  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  43.53 
 
 		 185 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  45.78 
 
 		 177 aa  140  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  45.4 
 
 		 167 aa  140  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  46.95 
 
 		 182 aa  140  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  45.68 
 
 		 168 aa  140  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  48.8 
 
 		 169 aa  140  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  48.17 
 
 		 170 aa  140  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  46.63 
 
 		 167 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  46.99 
 
 		 170 aa  140  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  46.99 
 
 		 170 aa  140  9e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  46.99 
 
 		 170 aa  140  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  46.11 
 
 		 175 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  47.56 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  42.51 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  45.06 
 
 		 168 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  46.71 
 
 		 172 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  43.53 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  45.4 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  45.88 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>