More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0818 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  100 
 
 		 171 aa  345  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  71.69 
 
 		 167 aa  260  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  75.15 
 
 		 172 aa  254  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  74.56 
 
 		 172 aa  253  8e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  70.7 
 
 		 172 aa  243  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  72.29 
 
 		 182 aa  239  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3216  peptide deformylase  70.37 
 
 		 166 aa  229  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0170058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  56.13 
 
 		 171 aa  191  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  53.46 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  52.8 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  48.77 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  47.95 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  51.9 
 
 		 167 aa  164  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  48.77 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  43.83 
 
 		 167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  50.6 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  50.62 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  50.32 
 
 		 170 aa  162  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  48.15 
 
 		 185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  48.43 
 
 		 167 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  48.43 
 
 		 167 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  50.97 
 
 		 169 aa  157  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  47.53 
 
 		 171 aa  157  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  47.53 
 
 		 171 aa  157  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  50.92 
 
 		 171 aa  157  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  47.53 
 
 		 171 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  47.27 
 
 		 171 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  48.43 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  50.92 
 
 		 171 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  44.97 
 
 		 170 aa  154  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  49.07 
 
 		 178 aa  154  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  48.15 
 
 		 174 aa  153  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  48.15 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  52.7 
 
 		 167 aa  153  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  53.9 
 
 		 176 aa  152  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  48.39 
 
 		 178 aa  153  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  51.27 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  51.27 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  49.69 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  47.83 
 
 		 169 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2039  peptide deformylase  45.4 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  50.64 
 
 		 172 aa  151  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  49.07 
 
 		 170 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0013  peptide deformylase  48.15 
 
 		 169 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  48.45 
 
 		 170 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  47.8 
 
 		 169 aa  150  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  51.23 
 
 		 171 aa  150  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  49.68 
 
 		 177 aa  150  8e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  46.67 
 
 		 170 aa  150  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  47.88 
 
 		 171 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  46.34 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  48.43 
 
 		 187 aa  149  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  48.45 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  46.34 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  50.31 
 
 		 172 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  50.31 
 
 		 171 aa  150  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  45.06 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  49.36 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  47.8 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  47.67 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  45.06 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  50.64 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  46.54 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  47.8 
 
 		 170 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  49.67 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  47.8 
 
 		 170 aa  148  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  47.8 
 
 		 170 aa  149  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  46.54 
 
 		 172 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  47.8 
 
 		 170 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  47.09 
 
 		 177 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  48.43 
 
 		 169 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  47.59 
 
 		 171 aa  148  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  47.27 
 
 		 171 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  49.03 
 
 		 170 aa  147  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  48.43 
 
 		 169 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  46.06 
 
 		 167 aa  147  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  48.43 
 
 		 169 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  50.31 
 
 		 178 aa  147  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  48.43 
 
 		 169 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  48.43 
 
 		 169 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  48.43 
 
 		 169 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  47.8 
 
 		 169 aa  147  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  47.8 
 
 		 169 aa  147  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  47.8 
 
 		 169 aa  147  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  47.8 
 
 		 169 aa  147  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  47.8 
 
 		 169 aa  147  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  47.8 
 
 		 169 aa  147  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  47.8 
 
 		 169 aa  147  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  47.8 
 
 		 169 aa  147  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  43.29 
 
 		 171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  47.24 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  44.71 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  46.3 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  47.9 
 
 		 170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  49.06 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  49.68 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  45.24 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  47.17 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  48.43 
 
 		 170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4749  peptide deformylase  49.12 
 
 		 173 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>