More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3216 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3216  peptide deformylase  100 
 
 		 166 aa  338  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0170058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  70.37 
 
 		 171 aa  249  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  73.72 
 
 		 172 aa  244  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  66.05 
 
 		 167 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  68.52 
 
 		 172 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  68.67 
 
 		 182 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  67.9 
 
 		 172 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  57.58 
 
 		 171 aa  189  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  52.41 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  51.23 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  52.41 
 
 		 185 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  51.81 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  52.41 
 
 		 185 aa  164  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  52.26 
 
 		 170 aa  164  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  49.41 
 
 		 174 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  50.62 
 
 		 171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  53.46 
 
 		 173 aa  160  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  46.39 
 
 		 167 aa  160  9e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  51.23 
 
 		 171 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  51.23 
 
 		 171 aa  159  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  50 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  51.83 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  50 
 
 		 171 aa  157  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  53.09 
 
 		 171 aa  157  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  46.11 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  46.11 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  47.31 
 
 		 175 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  50.93 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  51.55 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  50.31 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  50.31 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  50.31 
 
 		 187 aa  152  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  49.36 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  50.63 
 
 		 178 aa  152  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  50.3 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  48.73 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  49.39 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  49.39 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  48.26 
 
 		 193 aa  149  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  50.31 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2039  peptide deformylase  49.08 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  50.91 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  49.69 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0013  peptide deformylase  51.85 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  46.63 
 
 		 167 aa  148  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  50.62 
 
 		 170 aa  147  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  47.85 
 
 		 170 aa  147  6e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  48.47 
 
 		 170 aa  147  7e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  50 
 
 		 168 aa  147  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  48.78 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  51.85 
 
 		 178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  50.92 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  46.34 
 
 		 170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  46.91 
 
 		 170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  48.17 
 
 		 171 aa  145  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  48.78 
 
 		 172 aa  145  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  50 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3350  peptide deformylase  53.12 
 
 		 172 aa  144  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  53.74 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  46.25 
 
 		 169 aa  143  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  49.34 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0492  peptide deformylase  46.95 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  48.21 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0438  polypeptide deformylase  44.17 
 
 		 167 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  45.68 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0600  peptide deformylase  44.17 
 
 		 167 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  49.08 
 
 		 173 aa  141  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  47.5 
 
 		 169 aa  140  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  48.73 
 
 		 169 aa  141  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  51.37 
 
 		 158 aa  140  6e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  49.06 
 
 		 169 aa  140  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  47.56 
 
 		 168 aa  140  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  47.56 
 
 		 168 aa  140  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4240  peptide deformylase  48.15 
 
 		 173 aa  140  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  47.2 
 
 		 178 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3553  formylmethionine deformylase  46.3 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0187724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  49.38 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  48.37 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  48.17 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  48.17 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  48.48 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  45.28 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4749  peptide deformylase  48.15 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  49.69 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  45.4 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  46.01 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  46.84 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  42.44 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  47.83 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  46.95 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  43.51 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  48.17 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  48.48 
 
 		 168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  47.62 
 
 		 196 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  48.48 
 
 		 168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  46.84 
 
 		 172 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  51.49 
 
 		 152 aa  137  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  48.48 
 
 		 168 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  46.91 
 
 		 169 aa  137  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  48.43 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>