More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_09890 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  100 
 
 
154 aa  304  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  64.38 
 
 
152 aa  187  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  60.81 
 
 
155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  57.93 
 
 
164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  60.69 
 
 
150 aa  174  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  57.14 
 
 
154 aa  167  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  57.14 
 
 
152 aa  166  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1757  peptide deformylase  57.24 
 
 
166 aa  161  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  54.9 
 
 
156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  54.19 
 
 
166 aa  160  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  53.95 
 
 
170 aa  157  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  51.97 
 
 
159 aa  156  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  53.74 
 
 
167 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  50.34 
 
 
185 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  52.03 
 
 
157 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  50.34 
 
 
185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  50 
 
 
171 aa  152  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  53.95 
 
 
156 aa  152  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  48.98 
 
 
185 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  54.67 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  49.66 
 
 
185 aa  151  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  53.29 
 
 
156 aa  150  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  53.29 
 
 
156 aa  150  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  53.29 
 
 
156 aa  150  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  49.68 
 
 
167 aa  150  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  53.29 
 
 
156 aa  150  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  49.68 
 
 
167 aa  150  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  53.85 
 
 
163 aa  150  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  50.69 
 
 
147 aa  149  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  52.7 
 
 
158 aa  149  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  52.41 
 
 
172 aa  148  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  50.68 
 
 
157 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  51.7 
 
 
172 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  50.99 
 
 
162 aa  147  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  52.63 
 
 
156 aa  147  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  52.63 
 
 
156 aa  147  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  50.69 
 
 
147 aa  147  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  51.97 
 
 
158 aa  147  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  51.37 
 
 
171 aa  147  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  49.68 
 
 
171 aa  147  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  51.72 
 
 
172 aa  146  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  50.33 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  53.02 
 
 
170 aa  145  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  48.43 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  51.37 
 
 
169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  55.78 
 
 
182 aa  145  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  51.03 
 
 
170 aa  144  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  51.03 
 
 
170 aa  144  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  48.99 
 
 
162 aa  144  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  48 
 
 
176 aa  143  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  48.63 
 
 
167 aa  143  9e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  51.66 
 
 
156 aa  142  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  48.63 
 
 
167 aa  141  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  46 
 
 
171 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  49.32 
 
 
167 aa  141  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  52.38 
 
 
169 aa  141  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  46 
 
 
171 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  48.28 
 
 
164 aa  140  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  51.03 
 
 
153 aa  140  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  47.1 
 
 
169 aa  140  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  48 
 
 
167 aa  140  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  48.03 
 
 
167 aa  140  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  46.45 
 
 
169 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  46.45 
 
 
169 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3966  peptide deformylase  52.63 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  48.94 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  46.45 
 
 
169 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  46.45 
 
 
169 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  46.45 
 
 
169 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  47.59 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  46.45 
 
 
169 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1277  peptide deformylase  52.63 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  46.45 
 
 
169 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  46.45 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  46.45 
 
 
169 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  46.45 
 
 
169 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  46.45 
 
 
169 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  46.45 
 
 
169 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  46.45 
 
 
169 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  51.08 
 
 
172 aa  138  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  44.44 
 
 
167 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  49.32 
 
 
167 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  48.28 
 
 
169 aa  137  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  45.81 
 
 
169 aa  137  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  48.68 
 
 
170 aa  137  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  54.68 
 
 
172 aa  137  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  46.9 
 
 
177 aa  136  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  47.1 
 
 
191 aa  136  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  48.63 
 
 
167 aa  136  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  54.68 
 
 
172 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  45.81 
 
 
169 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  46.98 
 
 
190 aa  135  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  48.7 
 
 
167 aa  135  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  44 
 
 
174 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  48.28 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  47.59 
 
 
169 aa  134  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  48.98 
 
 
170 aa  134  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  48.28 
 
 
168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  48.28 
 
 
168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  44.94 
 
 
170 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>