More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1039 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  100 
 
 
166 aa  331  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  63.4 
 
 
170 aa  194  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  51.61 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  52.9 
 
 
155 aa  169  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  60.42 
 
 
152 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1757  peptide deformylase  57.14 
 
 
166 aa  167  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  58.5 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  53.21 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  54.3 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  54.19 
 
 
154 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  51.92 
 
 
157 aa  158  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  54.55 
 
 
156 aa  156  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  51.92 
 
 
156 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  51.92 
 
 
156 aa  155  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  51.92 
 
 
156 aa  155  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  49.65 
 
 
164 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  54.05 
 
 
158 aa  154  7e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  51.28 
 
 
156 aa  153  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  51.28 
 
 
156 aa  153  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  51.28 
 
 
156 aa  153  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  51.28 
 
 
156 aa  153  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  50.34 
 
 
152 aa  153  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  50.63 
 
 
158 aa  152  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  54.55 
 
 
150 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  52.78 
 
 
147 aa  150  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  52.74 
 
 
154 aa  150  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  50.61 
 
 
167 aa  148  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  52.78 
 
 
147 aa  148  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  49.36 
 
 
156 aa  143  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  54.48 
 
 
170 aa  143  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  54.48 
 
 
170 aa  143  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3966  peptide deformylase  50 
 
 
156 aa  142  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1277  peptide deformylase  50 
 
 
156 aa  142  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  52.41 
 
 
172 aa  140  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  50.34 
 
 
185 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  48.61 
 
 
178 aa  136  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  47.86 
 
 
153 aa  134  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  48.98 
 
 
185 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  52.74 
 
 
168 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  48.28 
 
 
169 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  52.05 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  52.05 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  48.3 
 
 
185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  47.62 
 
 
185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  50.68 
 
 
172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  45.34 
 
 
171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  48.3 
 
 
178 aa  131  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1783  peptide deformylase  47.62 
 
 
172 aa  130  6e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  48.32 
 
 
170 aa  130  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  45.96 
 
 
171 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1501  peptide deformylase  48.98 
 
 
174 aa  130  9e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  42.66 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  45.06 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  51.37 
 
 
168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  45.75 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  52.74 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  51.37 
 
 
168 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  52.05 
 
 
168 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  50.68 
 
 
178 aa  128  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  52.74 
 
 
168 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  47.37 
 
 
173 aa  129  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  48.37 
 
 
172 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  50.68 
 
 
168 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  48.98 
 
 
167 aa  127  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  48.3 
 
 
170 aa  127  9.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  50.68 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  51.72 
 
 
179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  45 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  49.29 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  45.58 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  52.05 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  51.72 
 
 
216 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  46.94 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  41.26 
 
 
164 aa  125  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  50 
 
 
181 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  41.92 
 
 
168 aa  125  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  51.72 
 
 
167 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  49.66 
 
 
167 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0600  peptide deformylase  43.79 
 
 
167 aa  125  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  51.72 
 
 
179 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  51.72 
 
 
167 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0438  polypeptide deformylase  43.79 
 
 
167 aa  125  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  43.02 
 
 
193 aa  125  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  48.28 
 
 
167 aa  125  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  51.72 
 
 
179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  50.34 
 
 
177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  51.72 
 
 
167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  51.72 
 
 
179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  46.21 
 
 
169 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0018  peptide deformylase  46.94 
 
 
171 aa  124  7e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  46.48 
 
 
169 aa  124  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  47.86 
 
 
192 aa  124  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  50 
 
 
168 aa  123  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  44.9 
 
 
167 aa  123  9e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  45.45 
 
 
169 aa  123  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  43.79 
 
 
174 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  46.58 
 
 
170 aa  123  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  44.16 
 
 
154 aa  123  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0184  peptide deformylase  44.37 
 
 
175 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.55747  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0222  peptide deformylase  44.37 
 
 
175 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>