More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1320 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  100 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  50.97 
 
 		 163 aa  153  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  53.29 
 
 		 170 aa  150  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  50.61 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  48.75 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  52.67 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  50.98 
 
 		 172 aa  147  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  49.69 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  53.29 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  50.66 
 
 		 178 aa  140  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  50 
 
 		 171 aa  140  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  50 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  51.41 
 
 		 185 aa  140  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  49.01 
 
 		 152 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  48.03 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  48.77 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1757  peptide deformylase  51.16 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  51.39 
 
 		 172 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  50.31 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  53.29 
 
 		 177 aa  137  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  51.41 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  50.7 
 
 		 185 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  50.69 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  50.98 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  51.32 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  48 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  50.67 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  52.08 
 
 		 171 aa  135  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  48.37 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  49.66 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  49.66 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  50 
 
 		 185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  49.66 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  46.36 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  48.7 
 
 		 170 aa  134  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  48.7 
 
 		 170 aa  134  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  47.06 
 
 		 173 aa  134  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  47.92 
 
 		 170 aa  134  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  46.45 
 
 		 170 aa  133  9e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  48.99 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  48.99 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  48.99 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  48.99 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  47.37 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  50.33 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  45.7 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  48.61 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  46.1 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  49.31 
 
 		 169 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  46.95 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  46.75 
 
 		 169 aa  132  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  50 
 
 		 169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  48.37 
 
 		 168 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  44.81 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  44.81 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  44.81 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  47.92 
 
 		 169 aa  130  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  48.37 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  48.37 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  46.75 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  46.94 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  44.81 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  43.51 
 
 		 168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  46.71 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  47.92 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  47.92 
 
 		 169 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  48.59 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  48.59 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  47.92 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  47.92 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  47.92 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  47.92 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  47.92 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  47.92 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  45.22 
 
 		 170 aa  127  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  47.92 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  47.92 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  47.92 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  47.92 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  45.86 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  47.92 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  47.71 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  47.44 
 
 		 180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  47.92 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  43.87 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  47.71 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  47.71 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  47.92 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  43.59 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  47.22 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  52.08 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  45.86 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  47.4 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1277  peptide deformylase  47.33 
 
 		 156 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  46.79 
 
 		 182 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3966  peptide deformylase  47.33 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  46.53 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  47.37 
 
 		 171 aa  124  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  44.23 
 
 		 167 aa  124  7e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  45.1 
 
 		 171 aa  123  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>