More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0857 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  100 
 
 
154 aa  307  4e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  62.34 
 
 
155 aa  179  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  59.06 
 
 
150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  58.17 
 
 
156 aa  170  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  54.67 
 
 
164 aa  169  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  57.14 
 
 
154 aa  167  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  55.63 
 
 
152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  58.9 
 
 
170 aa  159  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  51.66 
 
 
159 aa  159  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  55.84 
 
 
154 aa  156  9e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  52.38 
 
 
152 aa  154  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  52.56 
 
 
167 aa  154  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  52.56 
 
 
167 aa  154  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  53.24 
 
 
172 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1757  peptide deformylase  56.46 
 
 
166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  53.9 
 
 
173 aa  150  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  52.74 
 
 
166 aa  150  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  49.02 
 
 
151 aa  148  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  55.41 
 
 
185 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  54.05 
 
 
185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  54.73 
 
 
185 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  52.03 
 
 
170 aa  143  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  52.03 
 
 
170 aa  143  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  53.69 
 
 
185 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  51.02 
 
 
153 aa  142  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  50.65 
 
 
156 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  50.65 
 
 
156 aa  140  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  50.65 
 
 
156 aa  140  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  51.01 
 
 
171 aa  140  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  51.68 
 
 
167 aa  140  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  50 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  50 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  50 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  50 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  48.99 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  52.59 
 
 
177 aa  138  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  47.97 
 
 
147 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  49.68 
 
 
156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  48.65 
 
 
172 aa  137  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  48.65 
 
 
172 aa  137  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  50.98 
 
 
167 aa  136  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  52.26 
 
 
170 aa  136  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  50 
 
 
167 aa  136  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  47.97 
 
 
147 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  51.68 
 
 
172 aa  136  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  49.06 
 
 
167 aa  135  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  48.28 
 
 
171 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  51.85 
 
 
167 aa  135  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  48.7 
 
 
158 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  50 
 
 
191 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  50.33 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  47.3 
 
 
169 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  54.41 
 
 
178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  50.64 
 
 
171 aa  134  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  49.32 
 
 
177 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  50 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  49.33 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  48.05 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  50.37 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  50 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  45.95 
 
 
181 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  51.85 
 
 
169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  47.02 
 
 
185 aa  130  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  47.3 
 
 
169 aa  130  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  48.59 
 
 
167 aa  130  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  49.63 
 
 
169 aa  130  6e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  49.26 
 
 
167 aa  130  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  45.51 
 
 
176 aa  130  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  46.79 
 
 
177 aa  130  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  47.95 
 
 
180 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0906  peptide deformylase  43.75 
 
 
176 aa  130  7.999999999999999e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000931901 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  47.3 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  48.61 
 
 
169 aa  130  9e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  48.25 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  49.65 
 
 
170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  48.15 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  53.02 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  49.36 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1277  peptide deformylase  49.35 
 
 
156 aa  128  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  45.7 
 
 
171 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3966  peptide deformylase  48.7 
 
 
156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  48.72 
 
 
172 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  46.43 
 
 
201 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  47.3 
 
 
157 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  46.67 
 
 
185 aa  127  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  44.87 
 
 
175 aa  127  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0031  peptide deformylase  47.41 
 
 
199 aa  127  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  45.7 
 
 
171 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  50.37 
 
 
167 aa  127  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  42.95 
 
 
187 aa  127  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  42.95 
 
 
187 aa  127  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  45.68 
 
 
182 aa  127  7.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  45.14 
 
 
199 aa  127  8.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  44.59 
 
 
168 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  44.59 
 
 
168 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1493  peptide deformylase  43.57 
 
 
171 aa  126  8.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.977447  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  44.59 
 
 
168 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  45.22 
 
 
174 aa  126  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  54.07 
 
 
178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  46.53 
 
 
171 aa  125  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>