More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1645 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  100 
 
 		 169 aa  338  2e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  48.39 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  42.6 
 
 		 187 aa  151  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  42.6 
 
 		 187 aa  151  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  47.13 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  47.3 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  47.3 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  46.5 
 
 		 171 aa  148  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  45.96 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  45.86 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  46.5 
 
 		 177 aa  145  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  46.3 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  45.95 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  45 
 
 		 175 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  44.1 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  50 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  43.48 
 
 		 175 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  42.86 
 
 		 196 aa  141  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  46 
 
 		 202 aa  141  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  41.86 
 
 		 187 aa  140  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  46 
 
 		 202 aa  140  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  47.62 
 
 		 187 aa  140  8e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  51.25 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  43.2 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  39.77 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  45.22 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  47.02 
 
 		 189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  46.71 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  44.58 
 
 		 170 aa  137  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  44.58 
 
 		 170 aa  137  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  44.67 
 
 		 201 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  44.67 
 
 		 201 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  47.97 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  42.53 
 
 		 187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  43.54 
 
 		 187 aa  134  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  48.25 
 
 		 162 aa  133  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  46.1 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  44.76 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  41.4 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  37.08 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  43.56 
 
 		 168 aa  130  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  44 
 
 		 201 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  47.71 
 
 		 189 aa  130  6.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  43.56 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  49.63 
 
 		 154 aa  130  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  38.37 
 
 		 201 aa  130  7.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  43.42 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  42.86 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  42.86 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  44 
 
 		 188 aa  128  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  41.56 
 
 		 199 aa  128  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  42.86 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  43.98 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  43.11 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  43.98 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  43.37 
 
 		 182 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  42.67 
 
 		 170 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  44.85 
 
 		 169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  43.67 
 
 		 168 aa  128  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  43.67 
 
 		 168 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  47.59 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  42.67 
 
 		 170 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  38.55 
 
 		 193 aa  127  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  43.15 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  40.24 
 
 		 174 aa  127  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  44.3 
 
 		 168 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  44 
 
 		 170 aa  127  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  42.21 
 
 		 171 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  43.71 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  43.04 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  44.24 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  40.37 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  46.2 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  44.24 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  44.24 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  44.24 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  43.37 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  44.24 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  44.24 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  42.38 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  40.61 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  44.24 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  46.43 
 
 		 150 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  44.24 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  41.67 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  44.24 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  43.71 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  43.54 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  46.81 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  43.67 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  39.76 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  42.28 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  41.77 
 
 		 168 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  41.14 
 
 		 168 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0073  peptide deformylase  36.87 
 
 		 188 aa  124  5e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  43.05 
 
 		 181 aa  124  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4570  peptide deformylase  44 
 
 		 173 aa  124  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  43.84 
 
 		 171 aa  124  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  45.57 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  45.57 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>