More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0874 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  100 
 
 		 189 aa  377  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  48.65 
 
 		 196 aa  184  6e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  46.84 
 
 		 190 aa  181  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  44.32 
 
 		 196 aa  178  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1904  peptide deformylase  43.75 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  45.9 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  46.77 
 
 		 194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  45.79 
 
 		 196 aa  171  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  46.2 
 
 		 186 aa  166  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  48.19 
 
 		 193 aa  162  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  43.96 
 
 		 184 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  43.55 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  46.96 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  44.25 
 
 		 174 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  43.75 
 
 		 171 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  41.94 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  47.4 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  44.32 
 
 		 171 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  42.22 
 
 		 187 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  42.22 
 
 		 187 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  44.62 
 
 		 185 aa  154  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  43.78 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  40.54 
 
 		 186 aa  151  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  47.24 
 
 		 176 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  45.3 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  43.48 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  43.43 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  40.74 
 
 		 188 aa  148  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  46.51 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  42.2 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  50.32 
 
 		 173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3350  peptide deformylase  46.93 
 
 		 172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954138  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  45.09 
 
 		 185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  42.13 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5119  peptide deformylase  40.21 
 
 		 191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267223 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  49.11 
 
 		 169 aa  144  8.000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  41.11 
 
 		 177 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  41.11 
 
 		 177 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  44.83 
 
 		 182 aa  144  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  38.2 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  41.11 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  46.93 
 
 		 178 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  47.37 
 
 		 177 aa  141  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  45.03 
 
 		 168 aa  141  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  46.95 
 
 		 173 aa  141  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  42.29 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  44.25 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  44 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  42.29 
 
 		 167 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  45.61 
 
 		 168 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  45.4 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  47.13 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  44 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  44.59 
 
 		 187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  44.58 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  44 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  45.24 
 
 		 167 aa  139  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  42.6 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  42.61 
 
 		 168 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  43.02 
 
 		 171 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  43.6 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  44.05 
 
 		 174 aa  139  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  42.6 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  47.02 
 
 		 169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  45.4 
 
 		 168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  43.86 
 
 		 187 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  44 
 
 		 179 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  42.53 
 
 		 171 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  40.23 
 
 		 171 aa  138  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  42.53 
 
 		 171 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  43.95 
 
 		 187 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  42.29 
 
 		 167 aa  138  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  43.95 
 
 		 187 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  41.71 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  42.11 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  44.89 
 
 		 168 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  41.71 
 
 		 167 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  41.71 
 
 		 167 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  44.58 
 
 		 175 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  44.89 
 
 		 168 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  44.25 
 
 		 168 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4570  peptide deformylase  43.64 
 
 		 173 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  41.48 
 
 		 168 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  43.43 
 
 		 167 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  42.94 
 
 		 170 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  45.78 
 
 		 175 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  41.86 
 
 		 167 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  43.43 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  43.43 
 
 		 167 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  42.11 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  41.48 
 
 		 168 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  43.43 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  44.58 
 
 		 175 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  42.2 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  43.68 
 
 		 172 aa  136  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  41.48 
 
 		 168 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  40.68 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  41.71 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  43.27 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  41.95 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>