More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3965 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  77.96 
 
 		 187 aa  315  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  68.82 
 
 		 187 aa  284  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  66.67 
 
 		 187 aa  272  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  61.29 
 
 		 187 aa  252  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  63.98 
 
 		 188 aa  251  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  62.77 
 
 		 192 aa  249  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  61.67 
 
 		 201 aa  236  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  59.67 
 
 		 201 aa  230  9e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  59.78 
 
 		 201 aa  228  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  56.04 
 
 		 201 aa  219  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  58.19 
 
 		 201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  58.19 
 
 		 201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  57.06 
 
 		 201 aa  218  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  58.89 
 
 		 203 aa  217  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  58.62 
 
 		 202 aa  216  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  58.05 
 
 		 202 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  49.66 
 
 		 174 aa  148  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  47.3 
 
 		 169 aa  148  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  50 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  47.22 
 
 		 171 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  50 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  49.3 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  46.21 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  43.95 
 
 		 189 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  50 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  45.14 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  46.62 
 
 		 185 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  43.75 
 
 		 187 aa  134  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  43.71 
 
 		 182 aa  134  7.000000000000001e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  43.75 
 
 		 187 aa  134  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  45.27 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  46.62 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  40.54 
 
 		 162 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  45.65 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  43.88 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  45.03 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  46 
 
 		 196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  45.21 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  47.89 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  46.76 
 
 		 168 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  46.76 
 
 		 168 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  45.77 
 
 		 173 aa  131  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  45.95 
 
 		 185 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  45.28 
 
 		 169 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  44.93 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  44.93 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  49.31 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  42.95 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  41.1 
 
 		 164 aa  129  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  47.83 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  42.86 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  43.71 
 
 		 174 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  41.61 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  44 
 
 		 180 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  50 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  46.1 
 
 		 173 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  45.64 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  46.15 
 
 		 177 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  46.62 
 
 		 168 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  39.46 
 
 		 178 aa  127  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  42.18 
 
 		 177 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  42.36 
 
 		 171 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  42.18 
 
 		 177 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  44 
 
 		 199 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  42.36 
 
 		 171 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  48.25 
 
 		 170 aa  127  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  48.61 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  44.2 
 
 		 168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  45.12 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  48.61 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  48.61 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  45.95 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  42.28 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  42.07 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  43.75 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  41.1 
 
 		 164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  45.32 
 
 		 168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  44.93 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  45.64 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  44.9 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4570  peptide deformylase  46.04 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  45.27 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  44.76 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  46.81 
 
 		 169 aa  124  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  44.6 
 
 		 168 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  48.97 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  44.9 
 
 		 185 aa  124  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07980  peptide deformylase  45.86 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  45.27 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  44.93 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  47.92 
 
 		 179 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  44.93 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  47.92 
 
 		 167 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  47.92 
 
 		 167 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  47.92 
 
 		 216 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  40.69 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  46.38 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  44 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>