More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_07980 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_07980  peptide deformylase  100 
 
 		 175 aa  354  2.9999999999999997e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1713  peptide deformylase  64.37 
 
 		 183 aa  233  9e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  65.52 
 
 		 180 aa  228  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0868  peptide deformylase  45.88 
 
 		 180 aa  158  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.226218  normal  0.184037 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  41.92 
 
 		 174 aa  138  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  40.61 
 
 		 171 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  41.21 
 
 		 171 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  48.91 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  47.37 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  41.18 
 
 		 175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  43.97 
 
 		 187 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  38.85 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  38.85 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  45.1 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  46.27 
 
 		 201 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  43.05 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  44.65 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  44.65 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  40.24 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  41.4 
 
 		 177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  44.67 
 
 		 170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  45.86 
 
 		 187 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  45.86 
 
 		 187 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  38.75 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  42.86 
 
 		 201 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  45.03 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  44.36 
 
 		 202 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  38.75 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  44.36 
 
 		 202 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  45.11 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  44.53 
 
 		 187 aa  123  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  42.86 
 
 		 201 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  48.65 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  38.22 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  43.71 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  40 
 
 		 171 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  42.31 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  39.38 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  46.05 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  46.05 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  42.11 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  47.37 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  46.05 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  47.06 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  39.88 
 
 		 171 aa  121  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  48.87 
 
 		 153 aa  121  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  47.02 
 
 		 171 aa  121  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  40.23 
 
 		 179 aa  120  7e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4639  peptide deformylase  45.1 
 
 		 173 aa  120  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  47.89 
 
 		 185 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  44.67 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  43.31 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  41.45 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  44.29 
 
 		 147 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  42.76 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  49.3 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  38.55 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  39.51 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  44.83 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  38.55 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  37.95 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  41.33 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  43.71 
 
 		 169 aa  119  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  42.76 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  41.42 
 
 		 169 aa  119  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  44.74 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  42.96 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  42.04 
 
 		 173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  43.71 
 
 		 170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  43.71 
 
 		 170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  44.29 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  43.07 
 
 		 201 aa  117  7e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  44.76 
 
 		 150 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  42.11 
 
 		 154 aa  117  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  42.95 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  42.18 
 
 		 201 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0073  peptide deformylase  39.31 
 
 		 188 aa  116  9.999999999999999e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  38.71 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  40.7 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  40.4 
 
 		 187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  42.11 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  41.29 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  47.26 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  42.76 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0043  peptide deformylase  39.88 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.715813  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  37.8 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0038  peptide deformylase  41.45 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.346284 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  40.13 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  43.71 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  40.24 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  46.1 
 
 		 167 aa  115  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  46.1 
 
 		 167 aa  115  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  44.87 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  40.43 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  40.79 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  43.79 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  40.67 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  38.51 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  40.74 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  43.14 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>