More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1679 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  66.29 
 
 		 199 aa  258  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  64.32 
 
 		 188 aa  257  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  66.1 
 
 		 188 aa  254  6e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  64.2 
 
 		 186 aa  244  4e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  63.07 
 
 		 190 aa  242  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  61.24 
 
 		 185 aa  228  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  43.55 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  41.08 
 
 		 186 aa  147  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  42.33 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  47.31 
 
 		 175 aa  144  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  44.97 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  44.97 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  46.75 
 
 		 171 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  46.75 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  48.77 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  46.15 
 
 		 171 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  46.79 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  47.34 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1904  peptide deformylase  38.95 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  48.15 
 
 		 201 aa  138  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  46.67 
 
 		 170 aa  137  7e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  48.43 
 
 		 203 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  47.8 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  47.4 
 
 		 201 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  49.39 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  47.8 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  46.58 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  46.58 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  46.06 
 
 		 170 aa  136  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  45.68 
 
 		 169 aa  136  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  40.76 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  42.69 
 
 		 182 aa  134  8e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  40.94 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  37.7 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  45.12 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  47.4 
 
 		 201 aa  131  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  40.8 
 
 		 192 aa  131  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  43.29 
 
 		 178 aa  131  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  45.16 
 
 		 173 aa  131  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  47.33 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  47.02 
 
 		 154 aa  130  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  43.51 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  36.65 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  43.59 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  43.59 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  45.28 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  43.64 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  43.98 
 
 		 172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  45.28 
 
 		 178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  37.84 
 
 		 196 aa  128  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  42.53 
 
 		 177 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  42.53 
 
 		 177 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  42.07 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  44.87 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  45.1 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  46.1 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  45.45 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  48.15 
 
 		 152 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  44.52 
 
 		 150 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1326  hypothetical protein  38.89 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.368395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  46.26 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  43.23 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  42.5 
 
 		 169 aa  125  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  40.83 
 
 		 185 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  42.86 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  44.9 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  42.2 
 
 		 177 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  44.9 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  43.21 
 
 		 178 aa  124  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  42.59 
 
 		 179 aa  124  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  37.84 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  38.46 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  43.23 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  38.92 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  42.77 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  39.56 
 
 		 189 aa  122  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  45.22 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  42.95 
 
 		 173 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  45.22 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  46.48 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  46.05 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  43.37 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  43.37 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  44.23 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  39.52 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  40 
 
 		 193 aa  121  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  41.46 
 
 		 175 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  44.05 
 
 		 177 aa  121  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2534  peptide deformylase  41.51 
 
 		 167 aa  121  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2233  peptide deformylase  43.37 
 
 		 173 aa  121  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  40.24 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  41.32 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  41.82 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  47.97 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  39.66 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0163  peptide deformylase  44.97 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  42.36 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  41.67 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  41.51 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>