More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2534 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2534  peptide deformylase  100 
 
 		 167 aa  343  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0874  formylmethionine deformylase  97.01 
 
 		 167 aa  336  8e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0150  peptide deformylase  90.42 
 
 		 167 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0645  peptide deformylase  70.73 
 
 		 166 aa  248  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.732467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2578  formylmethionine deformylase  69.75 
 
 		 165 aa  231  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0624462  hitchhiker  0.00000631642 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0180  peptide deformylase  65.48 
 
 		 168 aa  228  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0468  formylmethionine deformylase  63.12 
 
 		 164 aa  209  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.855253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  48.5 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  48.5 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  47.9 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  46.11 
 
 		 174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  45.56 
 
 		 173 aa  150  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  44.31 
 
 		 174 aa  150  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  47.17 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  47.13 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  47.13 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  47.13 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  47.13 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  47.8 
 
 		 172 aa  136  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  47.83 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  47.13 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  47.13 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  46.1 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  45.62 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  46.5 
 
 		 181 aa  135  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  44.59 
 
 		 167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  43.03 
 
 		 187 aa  133  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  47.17 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  45.45 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  42.33 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  42.33 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  44.58 
 
 		 171 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  43.95 
 
 		 169 aa  132  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  44.81 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  43.45 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  44.64 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  44.58 
 
 		 171 aa  131  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  42.86 
 
 		 175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  44.71 
 
 		 177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  44.59 
 
 		 169 aa  131  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  44.85 
 
 		 196 aa  131  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  39.29 
 
 		 175 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  43.98 
 
 		 171 aa  130  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  44.38 
 
 		 171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  45 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  41.82 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  43.75 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  43.31 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  43.03 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  45.22 
 
 		 179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  45.62 
 
 		 177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  43.31 
 
 		 169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  45.45 
 
 		 169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  42.42 
 
 		 170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  46.15 
 
 		 172 aa  127  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  42.26 
 
 		 182 aa  127  7.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  45.51 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  43.21 
 
 		 173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  38.04 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  45.51 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  42.59 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  41.25 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  44.16 
 
 		 170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  44.16 
 
 		 170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  44.16 
 
 		 170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  45.95 
 
 		 169 aa  124  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  43.95 
 
 		 167 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  43.95 
 
 		 167 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  43.95 
 
 		 179 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  40.4 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  43.95 
 
 		 216 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  40.12 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  42.77 
 
 		 175 aa  124  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  39.87 
 
 		 168 aa  123  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  43.59 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  43.95 
 
 		 179 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  43.31 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  43.95 
 
 		 179 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  41.56 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  39.88 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  43.95 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  41.4 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  45.4 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  41.57 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  41.71 
 
 		 193 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  44.23 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  40.7 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  46.84 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  44.17 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  44.23 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  41.56 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  39.87 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  44.23 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  44.23 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  44.23 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  44.23 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  45.22 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  39.24 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  41.51 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  43.59 
 
 		 169 aa  121  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>