More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0468 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0468  formylmethionine deformylase  100 
 
 		 164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.855253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0150  peptide deformylase  65 
 
 		 167 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0874  formylmethionine deformylase  63.75 
 
 		 167 aa  210  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2534  peptide deformylase  63.12 
 
 		 167 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2578  formylmethionine deformylase  62.96 
 
 		 165 aa  208  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0624462  hitchhiker  0.00000631642 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0180  peptide deformylase  60.98 
 
 		 168 aa  202  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0645  peptide deformylase  60.62 
 
 		 166 aa  199  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.732467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  44.38 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  44.38 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  45.57 
 
 		 174 aa  140  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  43.12 
 
 		 177 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  42.6 
 
 		 196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  43.21 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  43.56 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  42.77 
 
 		 171 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  39.43 
 
 		 193 aa  130  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  41.98 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  42.77 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  43.98 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  42.77 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  41.42 
 
 		 175 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  39.64 
 
 		 175 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  40.37 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  40.12 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  41.42 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  40.12 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  39.41 
 
 		 175 aa  124  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  40.85 
 
 		 175 aa  124  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  38.24 
 
 		 182 aa  123  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  39.05 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  46.05 
 
 		 188 aa  123  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  39.41 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  40.96 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  40 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  39.16 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  39.51 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  39.62 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  39.51 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  40.13 
 
 		 169 aa  121  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  39.62 
 
 		 168 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4749  peptide deformylase  44.97 
 
 		 173 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  39.62 
 
 		 168 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  38.82 
 
 		 187 aa  120  7e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  39.62 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  38.99 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  37.95 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  40.24 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  38.36 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  39.63 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  39.63 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  37.65 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  39.51 
 
 		 171 aa  117  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  38.36 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  40 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  39.51 
 
 		 170 aa  117  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  37.65 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  39.51 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  37.04 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  37.65 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  40.88 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  40.88 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  37.04 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  40.12 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  37.5 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  37.65 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  40.88 
 
 		 176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  37.65 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  34.57 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  37.04 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  37.65 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  37.04 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0628  peptide deformylase  39.26 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.50576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  36.9 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  37.65 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  38.27 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  37.65 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4240  peptide deformylase  42.01 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003685 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  37.65 
 
 		 179 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  34.57 
 
 		 167 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  39.05 
 
 		 180 aa  113  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  38.92 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  37.65 
 
 		 216 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  39.39 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1032  peptide deformylase  37.74 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  40 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  41.36 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  36.42 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  37.65 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  37.65 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  38.92 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  37.65 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  41.98 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  41.98 
 
 		 185 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  36.42 
 
 		 184 aa  111  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  41.25 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  39.62 
 
 		 173 aa  110  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  37.04 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0017  peptide deformylase  38.04 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.746118  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  36.42 
 
 		 171 aa  110  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  37.58 
 
 		 171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>