More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1174 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  100 
 
 
162 aa  322  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  59.75 
 
 
169 aa  199  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0191  peptide deformylase  54.43 
 
 
162 aa  179  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0691522  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  50 
 
 
164 aa  160  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  50.63 
 
 
164 aa  159  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  49.09 
 
 
178 aa  152  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  39.76 
 
 
174 aa  138  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  43.9 
 
 
171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  38.04 
 
 
177 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  38.04 
 
 
177 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  48.25 
 
 
169 aa  133  8e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  35.98 
 
 
177 aa  133  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  40.54 
 
 
187 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  44.03 
 
 
167 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  40.54 
 
 
187 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  45.18 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  40.85 
 
 
171 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  41.94 
 
 
177 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  36.97 
 
 
174 aa  131  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  42.04 
 
 
168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  40.24 
 
 
171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  44.52 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  39.38 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  38.79 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  45.62 
 
 
170 aa  128  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  42.38 
 
 
183 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  40.83 
 
 
189 aa  127  5.0000000000000004e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  40.96 
 
 
175 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  40.76 
 
 
168 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4570  peptide deformylase  44.3 
 
 
173 aa  127  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  40 
 
 
178 aa  127  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  39.16 
 
 
175 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  42.21 
 
 
171 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  42.21 
 
 
171 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  43.4 
 
 
165 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  44.9 
 
 
164 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  43.95 
 
 
189 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  42.68 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  42.94 
 
 
190 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  43.75 
 
 
172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  38.89 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  41.67 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  41.67 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  39.77 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  40.12 
 
 
181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  39.39 
 
 
187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  38.89 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  39.76 
 
 
175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  38.89 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  39.46 
 
 
187 aa  125  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  37.71 
 
 
193 aa  125  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  38.78 
 
 
187 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  42.21 
 
 
171 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  38.27 
 
 
167 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  47.06 
 
 
154 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  38.27 
 
 
167 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  40 
 
 
201 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  41.25 
 
 
167 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  40.51 
 
 
201 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  48.53 
 
 
170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  49.28 
 
 
158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  40.13 
 
 
169 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2534  peptide deformylase  40.4 
 
 
167 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  38.27 
 
 
167 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1026  peptide deformylase  43.59 
 
 
168 aa  124  7e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000768351  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  38.85 
 
 
168 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  40.88 
 
 
171 aa  123  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  47.1 
 
 
172 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  42.04 
 
 
169 aa  123  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  38.85 
 
 
168 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  39.51 
 
 
174 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  39.87 
 
 
201 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  44.68 
 
 
155 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  40.56 
 
 
194 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  42.86 
 
 
159 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  38.55 
 
 
175 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  38.85 
 
 
168 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  40.12 
 
 
184 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  41.5 
 
 
173 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  42.01 
 
 
186 aa  122  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  38.85 
 
 
168 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  42.28 
 
 
154 aa  121  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  41.25 
 
 
167 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  37.65 
 
 
171 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  39.63 
 
 
177 aa  120  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  39.46 
 
 
187 aa  120  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  39.39 
 
 
185 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  37.65 
 
 
216 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  43.31 
 
 
169 aa  120  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  33.94 
 
 
174 aa  120  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  40.76 
 
 
167 aa  120  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  37.65 
 
 
167 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  37.65 
 
 
179 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  37.65 
 
 
167 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0392  peptide deformylase  37.85 
 
 
186 aa  120  9e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  41.22 
 
 
164 aa  120  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  40.74 
 
 
172 aa  120  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  38.85 
 
 
168 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  41.55 
 
 
152 aa  120  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  38.85 
 
 
168 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>