More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0163 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0163  peptide deformylase  100 
 
 		 195 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  71.2 
 
 		 194 aa  273  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2292  peptide deformylase  49.01 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  44.17 
 
 		 165 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  41.45 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  44.38 
 
 		 164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  45.4 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  45.73 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  41.76 
 
 		 178 aa  121  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  42.31 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  42.68 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  43.56 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  43.9 
 
 		 196 aa  117  9e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  44.3 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0018  peptide deformylase  38.33 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  41.98 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  39.89 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  40.83 
 
 		 171 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  43.58 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  40.85 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  42.59 
 
 		 164 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  43.29 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  39.23 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  43.48 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  39.88 
 
 		 150 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  41.72 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  39.56 
 
 		 170 aa  111  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  39.02 
 
 		 177 aa  111  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  39.02 
 
 		 177 aa  111  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  40.85 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  41.98 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  39.67 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  43.12 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  40.61 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  41.18 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  41.25 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  38.51 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  41.72 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  40.96 
 
 		 158 aa  109  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  39.55 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  37.71 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  40.76 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  41.1 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  41.18 
 
 		 180 aa  108  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  41.14 
 
 		 169 aa  108  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1477  peptide deformylase  42.94 
 
 		 173 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  39.63 
 
 		 170 aa  107  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  40.8 
 
 		 181 aa  107  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  38.65 
 
 		 174 aa  107  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1204  peptide deformylase  45.1 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  39.43 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  40.24 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1904  peptide deformylase  39.26 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  40.99 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  38.36 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  36.05 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  40.12 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  40.12 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  40 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  39.13 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  40 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  35.12 
 
 		 178 aa  106  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  34.08 
 
 		 230 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  39.51 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  41.36 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  39.02 
 
 		 189 aa  105  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1501  peptide deformylase  35.67 
 
 		 174 aa  105  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  39.74 
 
 		 176 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  42.41 
 
 		 170 aa  104  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1690  peptide deformylase  35.58 
 
 		 172 aa  104  7e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.736434  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  37.2 
 
 		 177 aa  104  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  38.27 
 
 		 170 aa  104  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  41.67 
 
 		 173 aa  104  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  38.12 
 
 		 171 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  40.61 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  37.43 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  41.67 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  38.59 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  39.62 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  38.18 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  35.84 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  35.84 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  41.03 
 
 		 154 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  43.21 
 
 		 167 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  38.99 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  42.11 
 
 		 152 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  37.04 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  40.37 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  38.27 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  35.45 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1783  peptide deformylase  33.53 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  39.04 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  38.07 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4432  peptide deformylase  39.75 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  37.04 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  35.45 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1508  peptide deformylase  35.68 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  39.87 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  33.7 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  38.04 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>