More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2292 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2292  peptide deformylase  100 
 
 		 216 aa  433  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  52.76 
 
 		 194 aa  190  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0163  peptide deformylase  49.01 
 
 		 195 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  38 
 
 		 178 aa  125  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  42.2 
 
 		 190 aa  121  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  38.42 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  39.88 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  40.46 
 
 		 174 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  38.62 
 
 		 185 aa  114  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  37.3 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  37.08 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  37.08 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  38.15 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  38.54 
 
 		 170 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  38.54 
 
 		 170 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  36.51 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  37.79 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  37.89 
 
 		 171 aa  111  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  37.79 
 
 		 186 aa  112  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  37.69 
 
 		 187 aa  111  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  37.69 
 
 		 187 aa  111  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  35.96 
 
 		 201 aa  111  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  40.46 
 
 		 189 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  33.15 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  38.15 
 
 		 175 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  37.87 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  39.88 
 
 		 177 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  37.87 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  38.17 
 
 		 165 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  37.82 
 
 		 170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  36.08 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  39.53 
 
 		 167 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  37.28 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  39.53 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4432  peptide deformylase  41.01 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  35.42 
 
 		 164 aa  109  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  37.28 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  35.6 
 
 		 185 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  40.88 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  39.64 
 
 		 164 aa  108  6e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  37.82 
 
 		 169 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  32.8 
 
 		 169 aa  108  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  40 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  37.7 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  40.24 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  39.08 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  36.6 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  37.06 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  36.63 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  38.42 
 
 		 169 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  40 
 
 		 180 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0639  peptide deformylase  37.06 
 
 		 174 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000242683  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  38.42 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  36.84 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  39.08 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  39.08 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33985  Peptide deformylase, organellar  36.99 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  38.37 
 
 		 154 aa  105  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  39.31 
 
 		 172 aa  104  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1713  peptide deformylase  35.75 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  40.58 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  40.94 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  36.04 
 
 		 178 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  39.13 
 
 		 152 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  38.78 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  37.98 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  35.79 
 
 		 162 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  38.29 
 
 		 167 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1477  peptide deformylase  42.96 
 
 		 173 aa  103  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  34.9 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  34.71 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  33.7 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  38.95 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  34.59 
 
 		 202 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  39.89 
 
 		 195 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  34.59 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  37.89 
 
 		 179 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1867  peptide deformylase  36.09 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.743166 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  39.47 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  38.01 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  36.84 
 
 		 170 aa  102  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  35.45 
 
 		 194 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1904  peptide deformylase  38.2 
 
 		 192 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  39.88 
 
 		 173 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  39.53 
 
 		 171 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  39.53 
 
 		 171 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  38.29 
 
 		 181 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  32.49 
 
 		 164 aa  101  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  34.38 
 
 		 170 aa  101  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  38.6 
 
 		 174 aa  101  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1204  peptide deformylase  41.67 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  35.48 
 
 		 159 aa  101  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  36.05 
 
 		 173 aa  101  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  41.01 
 
 		 179 aa  101  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  38.64 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  38.64 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  37.87 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  33.51 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  43.57 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  38.37 
 
 		 196 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>