More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1904 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1904  peptide deformylase  100 
 
 		 192 aa  400  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  58.85 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  53.44 
 
 		 189 aa  219  3e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  55.21 
 
 		 196 aa  215  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  55.5 
 
 		 196 aa  214  8e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  52.6 
 
 		 186 aa  204  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  51.55 
 
 		 190 aa  202  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  50.53 
 
 		 194 aa  188  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  48.42 
 
 		 184 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5119  peptide deformylase  46.52 
 
 		 191 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267223 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  43.75 
 
 		 189 aa  164  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  40.31 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  41.67 
 
 		 185 aa  144  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  38.95 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  39.25 
 
 		 186 aa  135  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  39.06 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  38.62 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1326  hypothetical protein  39.8 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.368395 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  38.25 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  37.1 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  39.78 
 
 		 180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  40 
 
 		 170 aa  122  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  37.16 
 
 		 177 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  37.16 
 
 		 177 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  39.44 
 
 		 170 aa  122  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  41.89 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  37.85 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  36.61 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  37.85 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  38.86 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  40.35 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  40 
 
 		 178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  39.2 
 
 		 170 aa  117  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  38.6 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  36.72 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  39.77 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  33.33 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  33.33 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  37.22 
 
 		 171 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  36.84 
 
 		 177 aa  114  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  37.78 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  40.11 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  39.66 
 
 		 168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  37.22 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  38.32 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  38.32 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  38.89 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  39.31 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  38.51 
 
 		 168 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  38.32 
 
 		 176 aa  110  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  36.11 
 
 		 174 aa  110  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  39.08 
 
 		 168 aa  110  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  35.39 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  35.2 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  37.43 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1026  peptide deformylase  36.67 
 
 		 168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000768351  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  36.9 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  40.94 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  38.71 
 
 		 172 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  35.06 
 
 		 170 aa  109  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  36.02 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  37.36 
 
 		 168 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  37.36 
 
 		 167 aa  108  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  36.78 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  36.78 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  36.21 
 
 		 176 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  34.64 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  34.64 
 
 		 179 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  34.64 
 
 		 179 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  33.52 
 
 		 167 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  32.96 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  36.78 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  34.83 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  36 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  35.71 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  36.78 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  35.06 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  35.96 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  36.78 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  35.84 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  32.96 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  32.96 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  37.36 
 
 		 168 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  32.96 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0191  peptide deformylase  34.86 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0691522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  37.16 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  35.26 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  36.42 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  37.93 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  34.27 
 
 		 184 aa  106  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  37.72 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  35.96 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  35.26 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  38.69 
 
 		 173 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  35.39 
 
 		 182 aa  106  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  32.96 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  37.72 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  36.21 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  32.96 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  38.6 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>