More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0693 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  100 
 
 		 184 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  58.25 
 
 		 194 aa  237  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  57.67 
 
 		 190 aa  233  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  60.53 
 
 		 196 aa  227  7e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  56.35 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  52.38 
 
 		 196 aa  201  6e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  53.37 
 
 		 196 aa  200  8e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1904  peptide deformylase  48.42 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  46.11 
 
 		 189 aa  166  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1326  hypothetical protein  45.11 
 
 		 188 aa  158  5e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.368395 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  43.01 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  42.94 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  40.33 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5119  peptide deformylase  42.78 
 
 		 191 aa  143  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267223 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  43.71 
 
 		 175 aa  141  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  41.38 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  40.72 
 
 		 187 aa  138  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  40.72 
 
 		 187 aa  138  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  41.42 
 
 		 171 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  41.9 
 
 		 199 aa  137  7.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  41.42 
 
 		 171 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  40.76 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  39.89 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  43.2 
 
 		 175 aa  134  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  40.74 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  43.79 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  40.48 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  39.55 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  40.86 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  39.64 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  40.72 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  41.67 
 
 		 177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  38.82 
 
 		 177 aa  130  9e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  38.82 
 
 		 177 aa  130  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  43.95 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  45.4 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  42.6 
 
 		 167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  40.12 
 
 		 189 aa  127  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  38.69 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  41.14 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  42.11 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  41.72 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  38.69 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  41.67 
 
 		 171 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  40.49 
 
 		 176 aa  124  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  42.51 
 
 		 185 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  37.06 
 
 		 177 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  41.82 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  38.69 
 
 		 184 aa  124  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  41.21 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  40.12 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  41.92 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  40.49 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  40.48 
 
 		 167 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  41.57 
 
 		 175 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  40.45 
 
 		 185 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  39.31 
 
 		 182 aa  122  4e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  42.67 
 
 		 203 aa  121  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  39.88 
 
 		 172 aa  120  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  40 
 
 		 201 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  39.88 
 
 		 172 aa  120  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  40.96 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  41.72 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  41.67 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  40 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2039  peptide deformylase  38.82 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  41.67 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  40 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  41.32 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  39.88 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  40.36 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  41.67 
 
 		 170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  40.46 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  39.88 
 
 		 168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  39.88 
 
 		 168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  41.07 
 
 		 170 aa  117  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  41.72 
 
 		 168 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  36.47 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  41.67 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  37.43 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1867  peptide deformylase  35.52 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.743166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  40.48 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  43.26 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  39.66 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  39.08 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  39.88 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  37.08 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  39.88 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  42.47 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  36.69 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  39.08 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  39.08 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  39.88 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  39.88 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  39.88 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  39.88 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  39.88 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  41.1 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  39.88 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>