More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1867 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1867  peptide deformylase  100 
 
 		 182 aa  375  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.743166 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0232  peptide deformylase  50 
 
 		 226 aa  184  6e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.961673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  41.99 
 
 		 192 aa  142  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  41.52 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  41.52 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  40.35 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  41.76 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  43.29 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  42.01 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  40.94 
 
 		 171 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  39.18 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  39.2 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  41.48 
 
 		 203 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  41.11 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  40.11 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2039  peptide deformylase  38.12 
 
 		 184 aa  124  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  43.12 
 
 		 176 aa  124  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  40.11 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  42.25 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  39.66 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  39.77 
 
 		 174 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  38.73 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  38.6 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  37.85 
 
 		 168 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  40.11 
 
 		 168 aa  121  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  40.45 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  40.85 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  38.2 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  40.11 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  38.46 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  37.85 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  38.2 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  37.5 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  37.85 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  39.55 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  39.55 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  37.85 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  36.78 
 
 		 213 aa  117  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  36.42 
 
 		 193 aa  117  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  37.29 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  38.89 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  36.36 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  35.52 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  38.42 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  37.57 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  36.16 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  37.64 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  38.2 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  37.64 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  38.29 
 
 		 177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  36.16 
 
 		 168 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  37.64 
 
 		 167 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  37.64 
 
 		 167 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  39.02 
 
 		 182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  39.02 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  38.2 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  36.46 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  34.64 
 
 		 202 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  37.8 
 
 		 196 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  35.75 
 
 		 202 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  38.07 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  38.2 
 
 		 167 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  41.32 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  37.5 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  37.36 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  38.89 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  38.32 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  37.08 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1713  peptide deformylase  39.56 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  39.76 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  39.76 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  37.99 
 
 		 170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  35.91 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  36.31 
 
 		 164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  39.26 
 
 		 154 aa  111  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  35.75 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  37.14 
 
 		 201 aa  111  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  39.88 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  36.59 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  36.52 
 
 		 167 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  36.52 
 
 		 167 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  35.96 
 
 		 179 aa  111  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  36.52 
 
 		 179 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  40.36 
 
 		 173 aa  111  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  36.87 
 
 		 189 aa  110  8.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  36.16 
 
 		 178 aa  110  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  36.52 
 
 		 216 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  40.23 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  36.52 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  36.52 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  36.87 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  37.43 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  36.87 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  38.55 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  37.08 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  35.39 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  36.52 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  37.43 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  37.8 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  36.87 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>