More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0232 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0232  peptide deformylase  100 
 
 		 226 aa  468  1.0000000000000001e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.961673 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1867  peptide deformylase  50 
 
 		 182 aa  184  9e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.743166 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  37.89 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2039  peptide deformylase  40 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  37.72 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  37.72 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  38.55 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  38.32 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  37.35 
 
 		 174 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  36.26 
 
 		 168 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  37.95 
 
 		 203 aa  104  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  36.26 
 
 		 168 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  37.14 
 
 		 169 aa  104  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  36.26 
 
 		 168 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  37.35 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  33.89 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  36.14 
 
 		 171 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  37.13 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  35.47 
 
 		 170 aa  102  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  36.14 
 
 		 171 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  35.71 
 
 		 168 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  38.41 
 
 		 175 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  35.93 
 
 		 175 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  37.02 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  34.48 
 
 		 169 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  36.59 
 
 		 175 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  37.22 
 
 		 176 aa  99.8  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  33.72 
 
 		 193 aa  99.8  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  40.36 
 
 		 189 aa  99.8  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  35.75 
 
 		 168 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  36.87 
 
 		 168 aa  99.4  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  35.26 
 
 		 167 aa  99.4  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  34.08 
 
 		 168 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  36.78 
 
 		 178 aa  99.4  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  35.75 
 
 		 168 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  36.59 
 
 		 175 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  37.02 
 
 		 184 aa  99  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  35.8 
 
 		 167 aa  98.6  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  32.39 
 
 		 174 aa  98.6  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  38.42 
 
 		 208 aa  98.6  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  34.64 
 
 		 168 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  33.52 
 
 		 172 aa  98.6  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  34.43 
 
 		 167 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  34.64 
 
 		 168 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  38.04 
 
 		 176 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  36.41 
 
 		 171 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  35.63 
 
 		 169 aa  97.8  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  35.62 
 
 		 170 aa  97.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  36 
 
 		 167 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0018  peptide deformylase  32.95 
 
 		 171 aa  97.1  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  36.59 
 
 		 173 aa  97.1  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0392  peptide deformylase  36.14 
 
 		 186 aa  96.7  3e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  37.2 
 
 		 175 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  35.98 
 
 		 175 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  35.98 
 
 		 175 aa  95.9  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  37.35 
 
 		 171 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  38.18 
 
 		 171 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  35.2 
 
 		 168 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  33.71 
 
 		 170 aa  95.1  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  37.34 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  36.81 
 
 		 157 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1690  peptide deformylase  33.54 
 
 		 172 aa  94.7  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.736434  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4240  peptide deformylase  38.41 
 
 		 173 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003685 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  34.48 
 
 		 177 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  35.47 
 
 		 177 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  35.06 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  33.71 
 
 		 169 aa  93.2  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  35.06 
 
 		 202 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  35.98 
 
 		 201 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  35.67 
 
 		 188 aa  92.4  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  35.98 
 
 		 171 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  39.05 
 
 		 182 aa  92  7e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  33.74 
 
 		 186 aa  91.7  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  34.97 
 
 		 154 aa  91.7  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  37.35 
 
 		 172 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  35.06 
 
 		 162 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  36.59 
 
 		 172 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  35.23 
 
 		 177 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  35.23 
 
 		 177 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  35.37 
 
 		 171 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  34.83 
 
 		 180 aa  91.3  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  35.98 
 
 		 173 aa  90.9  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  35.37 
 
 		 171 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  34.15 
 
 		 158 aa  90.9  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  31.43 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  34.41 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  35.62 
 
 		 150 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  31.22 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  33.72 
 
 		 187 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  34.76 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  35.95 
 
 		 154 aa  89.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  36.65 
 
 		 167 aa  89.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  33.33 
 
 		 184 aa  89.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  32.18 
 
 		 181 aa  89.4  4e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  33.18 
 
 		 196 aa  89.4  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  34.73 
 
 		 196 aa  89.7  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  35.4 
 
 		 183 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  33.72 
 
 		 172 aa  89  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  33.54 
 
 		 156 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  33.74 
 
 		 167 aa  89  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>