More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3916 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  100 
 
 		 208 aa  426  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  58.38 
 
 		 191 aa  217  7.999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2193  peptide deformylase  44.26 
 
 		 226 aa  158  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00150941  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1935  peptide deformylase  47.13 
 
 		 226 aa  154  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000939667 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35850  Peptide deformylase, mitochondrial  46.2 
 
 		 274 aa  145  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0664  Peptide deformylase  43.78 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106067  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1147  peptide deformylase  41.3 
 
 		 217 aa  141  6e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29330  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  41.53 
 
 		 211 aa  141  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0944  peptide deformylase  42.7 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2610  Peptide deformylase  45.14 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3103  peptide deformylase  47.19 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0620  peptide deformylase  45.56 
 
 		 245 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  44.13 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  42.42 
 
 		 177 aa  119  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  39.39 
 
 		 186 aa  118  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  41.86 
 
 		 169 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  40.94 
 
 		 177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12740  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  44.3 
 
 		 240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.869353  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  38.65 
 
 		 177 aa  114  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  39.88 
 
 		 177 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  37.5 
 
 		 177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  39.88 
 
 		 177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  35.36 
 
 		 178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  39.88 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  40.72 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  36.97 
 
 		 172 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  40.74 
 
 		 172 aa  109  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  38.95 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  38.04 
 
 		 183 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  42.24 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  39.88 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  37.8 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  39.39 
 
 		 174 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  38.33 
 
 		 164 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  39.26 
 
 		 179 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  38.6 
 
 		 178 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  33.69 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  33.69 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  37.2 
 
 		 179 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  40.85 
 
 		 176 aa  104  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1867  peptide deformylase  38.86 
 
 		 182 aa  104  9e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.743166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  38.6 
 
 		 178 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  37.79 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  37.13 
 
 		 179 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  36.07 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  38.89 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  38.85 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  39.35 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  33.94 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  36.05 
 
 		 177 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  40.48 
 
 		 150 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  37.95 
 
 		 168 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  36.16 
 
 		 178 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  37.43 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  37.95 
 
 		 168 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  37.21 
 
 		 177 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  36.81 
 
 		 179 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  37.21 
 
 		 177 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  37.21 
 
 		 177 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  37.21 
 
 		 177 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  35.5 
 
 		 177 aa  101  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  37.21 
 
 		 177 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  39.78 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0666  hypothetical protein  40.13 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  34.73 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  42.07 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  38.1 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5119  peptide deformylase  34.34 
 
 		 191 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267223 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  36.05 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  33.13 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  36.14 
 
 		 168 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  38.65 
 
 		 155 aa  99.8  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  36.63 
 
 		 177 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  36.63 
 
 		 177 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  39.51 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  39.39 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  39.26 
 
 		 167 aa  99.8  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  36.2 
 
 		 179 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  37.35 
 
 		 179 aa  99.8  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  37.35 
 
 		 179 aa  99.8  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  39.73 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  36.14 
 
 		 168 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  37.42 
 
 		 171 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3474  peptide deformylase  37.35 
 
 		 175 aa  99.4  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  37.72 
 
 		 168 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  35.93 
 
 		 181 aa  99.4  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  33.88 
 
 		 192 aa  99  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  42.51 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0232  peptide deformylase  38.42 
 
 		 226 aa  98.6  6e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.961673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  38.32 
 
 		 168 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  38.55 
 
 		 168 aa  98.6  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  36.75 
 
 		 168 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  38.79 
 
 		 179 aa  98.2  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  37.28 
 
 		 168 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  36.31 
 
 		 177 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  40.12 
 
 		 190 aa  97.8  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  35.29 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0073  peptide deformylase  39.16 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  36.6 
 
 		 171 aa  97.4  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  37.8 
 
 		 157 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>