More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1371 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  100 
 
 		 191 aa  387  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  58.38 
 
 		 208 aa  217  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2193  peptide deformylase  47.46 
 
 		 226 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00150941  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0944  peptide deformylase  46.11 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29330  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  46.55 
 
 		 211 aa  134  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1147  peptide deformylase  45.51 
 
 		 217 aa  134  8e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1935  peptide deformylase  45.29 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000939667 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35850  Peptide deformylase, mitochondrial  45.51 
 
 		 274 aa  131  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0664  Peptide deformylase  44.15 
 
 		 223 aa  127  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106067  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2610  Peptide deformylase  48.24 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  45.16 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3103  peptide deformylase  45.51 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  45.16 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  41.4 
 
 		 187 aa  117  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  41.4 
 
 		 187 aa  117  7.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  40.25 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  44.38 
 
 		 189 aa  114  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  38.55 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  40.12 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  42.58 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  41.76 
 
 		 170 aa  111  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  41.76 
 
 		 170 aa  111  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  40.74 
 
 		 176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  39.05 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  38.41 
 
 		 168 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  41.46 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  43.31 
 
 		 171 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  34.76 
 
 		 168 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0620  peptide deformylase  42.86 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  37.8 
 
 		 168 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  43.21 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  40.85 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  40.46 
 
 		 155 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  37.85 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  40.12 
 
 		 150 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  39.34 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  37.95 
 
 		 170 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4432  peptide deformylase  37.91 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  40.36 
 
 		 170 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  37.2 
 
 		 168 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  41.07 
 
 		 173 aa  105  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  42.86 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  36.36 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  35.37 
 
 		 168 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  34.76 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  38.82 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  39.88 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  36.75 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  37.35 
 
 		 167 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  34.15 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0017  peptide deformylase  34.94 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.746118  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  41.32 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  36.53 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  36.53 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  37.65 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  36.53 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  36.53 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  37.5 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  39.76 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  34.76 
 
 		 168 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  38.46 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  36.14 
 
 		 170 aa  102  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  36.53 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  41.88 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  38.79 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  34.91 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  36.75 
 
 		 168 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  36.75 
 
 		 168 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  36.75 
 
 		 168 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  37.82 
 
 		 169 aa  101  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  44.08 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  37.95 
 
 		 175 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  38.01 
 
 		 172 aa  101  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  42.94 
 
 		 185 aa  101  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  39.26 
 
 		 179 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  39.05 
 
 		 190 aa  101  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  38 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  40.41 
 
 		 175 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  37.78 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  39.51 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  41.14 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  38.99 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  40.49 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0031  peptide deformylase  36.84 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  37.77 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  40.49 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  36.81 
 
 		 177 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  38.1 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  37.28 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  34.13 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  39.26 
 
 		 177 aa  99.8  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  37.5 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  37.5 
 
 		 164 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  37.06 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0906  peptide deformylase  36.05 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000931901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  38.65 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  38.65 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  38.27 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  34.13 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  39.88 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>