More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0780 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  100 
 
 		 177 aa  359  1e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  66.1 
 
 		 177 aa  245  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  68.82 
 
 		 177 aa  243  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  68.02 
 
 		 179 aa  230  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  65.48 
 
 		 177 aa  229  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  63.28 
 
 		 177 aa  229  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  64.88 
 
 		 177 aa  228  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  64.29 
 
 		 177 aa  226  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  64.29 
 
 		 177 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  63.69 
 
 		 177 aa  223  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  63.53 
 
 		 174 aa  221  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  64 
 
 		 177 aa  220  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  62.72 
 
 		 177 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  64.53 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  62.29 
 
 		 177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  63.43 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  63.43 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  63.43 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  63.43 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  64.29 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  63.43 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  62.29 
 
 		 177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  57.56 
 
 		 181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  59.66 
 
 		 204 aa  218  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  62.86 
 
 		 177 aa  217  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  62.86 
 
 		 177 aa  217  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  59.43 
 
 		 177 aa  215  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  60.82 
 
 		 179 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  64.61 
 
 		 200 aa  210  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  63.84 
 
 		 178 aa  210  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  65.17 
 
 		 179 aa  210  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  61.99 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  61.99 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  57.63 
 
 		 178 aa  208  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  62.36 
 
 		 179 aa  207  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  60.11 
 
 		 186 aa  207  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  58.24 
 
 		 179 aa  207  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  57.63 
 
 		 178 aa  206  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  57.63 
 
 		 178 aa  207  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  62.29 
 
 		 177 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  62.29 
 
 		 177 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  62.29 
 
 		 177 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  55.93 
 
 		 178 aa  203  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  57.65 
 
 		 179 aa  202  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  59.41 
 
 		 179 aa  202  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  64.25 
 
 		 186 aa  201  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  62.13 
 
 		 177 aa  200  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  58.24 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  59.43 
 
 		 177 aa  197  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  54.82 
 
 		 171 aa  187  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  49.7 
 
 		 181 aa  178  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  49.42 
 
 		 207 aa  161  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  51.59 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  45.29 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  41.76 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  39.61 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  40.79 
 
 		 176 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  40.4 
 
 		 179 aa  124  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  42.18 
 
 		 182 aa  124  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  45.61 
 
 		 178 aa  120  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  37.75 
 
 		 181 aa  121  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  39.47 
 
 		 182 aa  117  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  38.06 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  37.42 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  38.65 
 
 		 208 aa  114  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  38.04 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35850  Peptide deformylase, mitochondrial  37.57 
 
 		 274 aa  111  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  33.14 
 
 		 177 aa  111  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  37.57 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  42.11 
 
 		 155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  35.1 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  34.64 
 
 		 178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  37.21 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  41.45 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  38.93 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  40 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  43.59 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  38.82 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  42.31 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  41.67 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  38.16 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  38.46 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  40.65 
 
 		 180 aa  104  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  38.16 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  40.69 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  36.65 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  40.26 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  37.82 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  38.06 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  37.5 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  43.59 
 
 		 191 aa  101  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  42.34 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  38.82 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  38.82 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  36.18 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  37.82 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  37.82 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  36.18 
 
 		 201 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  36.84 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  39.47 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>